More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5093 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 		 385 aa  768    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  40.41 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  40.33 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  40.24 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  44.48 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  42.2 
 
 		 462 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.97 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  39.37 
 
 		 308 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  35.48 
 
 		 358 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  41.05 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  39.75 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  35.41 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  42.16 
 
 		 318 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  33.6 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.23 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.58 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.07 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.98 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.17 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  39.69 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  39.93 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  41.04 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  37.71 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  41.11 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  37.23 
 
 		 334 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  36.54 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  38.11 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  36.43 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.24 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  34.93 
 
 		 315 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  31.41 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.54 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.54 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  38.91 
 
 		 275 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  35.26 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  36.04 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.4 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  36.76 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  28.52 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  31.85 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.11 
 
 		 581 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.75 
 
 		 560 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  32.89 
 
 		 219 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 		 575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.02 
 
 		 541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.67 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  33.47 
 
 		 562 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.05 
 
 		 563 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  31 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.99 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  31.11 
 
 		 542 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 560 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 560 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.11 
 
 		 557 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.36 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 560 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 560 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  29.17 
 
 		 256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  29.91 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  29.26 
 
 		 255 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.22 
 
 		 551 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 		 578 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  29.02 
 
 		 255 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.11 
 
 		 578 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.91 
 
 		 566 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  28.38 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  28.38 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  28.38 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  28.95 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  28.38 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  28.38 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  29.26 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30 
 
 		 547 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  28.66 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  27.95 
 
 		 255 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  29.17 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.27 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.71 
 
 		 623 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.46 
 
 		 544 aa  104  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.71 
 
 		 623 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.73 
 
 		 628 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.37 
 
 		 537 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.18 
 
 		 554 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.49 
 
 		 542 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.38 
 
 		 626 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.11 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.02 
 
 		 554 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  28.76 
 
 		 557 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>