More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5412 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
385 aa  788    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  45.26 
 
 
358 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.43 
 
 
376 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.81 
 
 
366 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.72 
 
 
367 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.72 
 
 
374 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.24 
 
 
367 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.24 
 
 
367 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  47.08 
 
 
390 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.34 
 
 
411 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  41.42 
 
 
346 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.21 
 
 
287 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  36.58 
 
 
461 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  34.75 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  37.92 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  35.74 
 
 
462 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  30.11 
 
 
366 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.24 
 
 
363 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.08 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  32.35 
 
 
308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.36 
 
 
351 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  34.73 
 
 
318 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  33.46 
 
 
316 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  30.66 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  35.88 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  26.8 
 
 
366 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  32.23 
 
 
328 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  29.8 
 
 
365 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.52 
 
 
384 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.41 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  31.06 
 
 
337 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  30.79 
 
 
314 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  31.18 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  30.91 
 
 
335 aa  119  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  29.68 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  26.51 
 
 
315 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  31.23 
 
 
266 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  30.21 
 
 
382 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  28.98 
 
 
257 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  28.52 
 
 
278 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  33.19 
 
 
268 aa  97.1  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.69 
 
 
541 aa  96.3  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  47.73 
 
 
309 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.41 
 
 
566 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
577 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  38.46 
 
 
246 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  30.15 
 
 
261 aa  91.3  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  38.84 
 
 
213 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  28.52 
 
 
256 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  28.57 
 
 
332 aa  89.4  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
565 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.47 
 
 
626 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
564 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.68 
 
 
584 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  26.22 
 
 
255 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  38.33 
 
 
547 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
545 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.33 
 
 
600 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  27.9 
 
 
291 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  43.18 
 
 
548 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  25.94 
 
 
255 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  43.18 
 
 
548 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  28.16 
 
 
551 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.18 
 
 
548 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  26.72 
 
 
514 aa  87.4  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
543 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.3 
 
 
541 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  24.5 
 
 
341 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  25.84 
 
 
255 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  25.94 
 
 
258 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
543 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
544 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  24.13 
 
 
570 aa  87  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
546 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
546 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
546 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  25.94 
 
 
255 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.12 
 
 
544 aa  86.7  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
543 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.61 
 
 
628 aa  86.3  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  32.28 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  25.94 
 
 
553 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  37.39 
 
 
604 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.53 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  33.87 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  26.63 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>