More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13956 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
366 aa  752    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  75.47 
 
 
374 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  73.8 
 
 
376 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  74.66 
 
 
367 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  74.93 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  74.93 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  59.06 
 
 
390 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  54.23 
 
 
411 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  45.43 
 
 
358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  46.33 
 
 
385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  44.04 
 
 
346 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  50 
 
 
287 aa  288  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.38 
 
 
385 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  34.29 
 
 
461 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  34.64 
 
 
370 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  37.82 
 
 
338 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
462 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.61 
 
 
351 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 
363 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 
334 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  32.47 
 
 
308 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  29.89 
 
 
316 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.1 
 
 
314 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  30.66 
 
 
318 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  35.47 
 
 
315 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  30.94 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  30.04 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  34.85 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  29.95 
 
 
337 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  28.53 
 
 
365 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  34.63 
 
 
324 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.89 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  28.62 
 
 
366 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  27.64 
 
 
350 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  27.63 
 
 
315 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  34.71 
 
 
266 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  33.68 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  30.57 
 
 
382 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  27.73 
 
 
332 aa  122  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  27.7 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  27.72 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  28.73 
 
 
268 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.28 
 
 
584 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  25.76 
 
 
281 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  25.19 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  25.61 
 
 
291 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  27.53 
 
 
345 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.63 
 
 
577 aa  95.9  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.16 
 
 
517 aa  95.9  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  25.58 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  26.01 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  27.51 
 
 
256 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  24.26 
 
 
278 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  27.24 
 
 
545 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.69 
 
 
532 aa  93.2  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  27.51 
 
 
254 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  25.86 
 
 
551 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.5 
 
 
567 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  41.18 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.12 
 
 
600 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.21 
 
 
628 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  24.74 
 
 
570 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  28.57 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.86 
 
 
541 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.91 
 
 
541 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  25.6 
 
 
556 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.26 
 
 
581 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.94 
 
 
536 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  30.82 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  40.62 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  24.64 
 
 
545 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  28.81 
 
 
223 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  24.31 
 
 
567 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.43 
 
 
542 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
787 aa  85.9  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.19 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.19 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  25.26 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.45 
 
 
557 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.82 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.19 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.15 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.53 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  27.2 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  24.29 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  25 
 
 
560 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.61 
 
 
672 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  25.65 
 
 
255 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  39.6 
 
 
246 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.93 
 
 
541 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  24.91 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  34.38 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  25.09 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.78 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.53 
 
 
544 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.53 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  24.62 
 
 
628 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  23.81 
 
 
557 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  25.65 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>