More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0005 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  99.18 
 
 
367 aa  747    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
367 aa  752    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
367 aa  752    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  82.49 
 
 
374 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  80.27 
 
 
376 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  74.93 
 
 
366 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  54.35 
 
 
411 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  59.81 
 
 
390 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  48.55 
 
 
358 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  47.29 
 
 
346 aa  309  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  50.36 
 
 
287 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  49.33 
 
 
385 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  35.86 
 
 
461 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.43 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.9 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  34.01 
 
 
462 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  32.09 
 
 
370 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  31.96 
 
 
338 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  29.32 
 
 
366 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.53 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  31.06 
 
 
365 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  32.92 
 
 
314 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  30.97 
 
 
316 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  30.62 
 
 
308 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.5 
 
 
384 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  30.9 
 
 
328 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  33.89 
 
 
324 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  31.31 
 
 
366 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  28.71 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  30.62 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  34 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  31.5 
 
 
318 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  32.74 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  29.07 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.79 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  34.07 
 
 
266 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  29.54 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  34.08 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  31.9 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  31.15 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  28.84 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  28.33 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  26.01 
 
 
257 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.78 
 
 
584 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  27 
 
 
281 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  38.61 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  28.81 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  27.94 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  25.53 
 
 
291 aa  92.8  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  34.22 
 
 
542 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.64 
 
 
567 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
517 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  27 
 
 
551 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  25.57 
 
 
300 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.22 
 
 
581 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  25.53 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
546 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
546 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
546 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.2 
 
 
532 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.9 
 
 
628 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.32 
 
 
600 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  25.42 
 
 
557 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  29.24 
 
 
271 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  22.03 
 
 
278 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.19 
 
 
577 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.34 
 
 
787 aa  87  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  38.58 
 
 
229 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
606 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  34.23 
 
 
257 aa  86.3  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.81 
 
 
545 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  23.68 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.95 
 
 
623 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.66 
 
 
543 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  36.36 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.66 
 
 
544 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.95 
 
 
623 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.27 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  36.36 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  25.61 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  25.61 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 
560 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  51.39 
 
 
672 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  24.92 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  26.04 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  25.48 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.66 
 
 
543 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.19 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  38.95 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 
548 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 
548 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 
548 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>