More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1439 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  100 
 
 		 335 aa  698    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  61.75 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  38.41 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  36.05 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  36.02 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  35.47 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  35 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  35.95 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.77 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  33.94 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  32.94 
 
 		 350 aa  173  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  32.34 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  33.44 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.01 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  33.59 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  33.47 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  31.55 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  30.12 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  30.03 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  29.85 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  32.17 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  32.42 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.23 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  30.19 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  26.91 
 
 		 308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.94 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  31.14 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.94 
 
 		 390 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  26.86 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  30.59 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  30.91 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.44 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  27.84 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  28.92 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  30.57 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  27.7 
 
 		 462 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  27.69 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.22 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.56 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  26.11 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.42 
 
 		 577 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  27.69 
 
 		 553 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  30.56 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  28.25 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  28.18 
 
 		 246 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  28.9 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  34.69 
 
 		 233 aa  99.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.71 
 
 		 532 aa  99.4  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  26.49 
 
 		 425 aa  99.4  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.66 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 		 600 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.86 
 
 		 626 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 		 584 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.66 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.2 
 
 		 531 aa  98.6  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.66 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  30 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  29.58 
 
 		 255 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.09 
 
 		 542 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  28.44 
 
 		 255 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  27.98 
 
 		 255 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  27.98 
 
 		 255 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.09 
 
 		 518 aa  97.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.03 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  26.52 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.77 
 
 		 517 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  39.84 
 
 		 223 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  28.82 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.17 
 
 		 608 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  43.75 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.29 
 
 		 542 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 		 539 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  26.69 
 
 		 548 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.53 
 
 		 536 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.79 
 
 		 541 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.21 
 
 		 557 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  24.1 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  27.86 
 
 		 589 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0504  preprotein translocase subunit  36.92 
 
 		 198 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  27.76 
 
 		 604 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.07 
 
 		 581 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  27.69 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.08 
 
 		 526 aa  89.7  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  38.66 
 
 		 229 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  27 
 
 		 600 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.72 
 
 		 621 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  34.65 
 
 		 543 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  28.12 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.98 
 
 		 578 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  25.3 
 
 		 541 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  24.81 
 
 		 547 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.86 
 
 		 607 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  28.18 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>