More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3326 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  64.25 
 
 
223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  58.26 
 
 
300 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  53.07 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  45.05 
 
 
225 aa  201  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  48.39 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.13 
 
 
532 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  36.87 
 
 
542 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  40.45 
 
 
217 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.04 
 
 
517 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.09 
 
 
530 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.09 
 
 
528 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.09 
 
 
531 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  37.83 
 
 
559 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.62 
 
 
530 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  38.86 
 
 
209 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.62 
 
 
518 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.73 
 
 
536 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  35.27 
 
 
553 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  39.05 
 
 
583 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.68 
 
 
526 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  41.84 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  36.49 
 
 
542 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  40.74 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  36.79 
 
 
536 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.21 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  34.92 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  35.85 
 
 
537 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  35.68 
 
 
536 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.79 
 
 
532 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  35.07 
 
 
530 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  35.21 
 
 
528 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.91 
 
 
610 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.91 
 
 
610 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.35 
 
 
556 aa  128  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.05 
 
 
555 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  35.55 
 
 
553 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  35.1 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  37.5 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 
567 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.91 
 
 
607 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.58 
 
 
555 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.39 
 
 
540 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
557 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.04 
 
 
575 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  31.84 
 
 
425 aa  125  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
558 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
554 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
554 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.1 
 
 
550 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
609 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  37.39 
 
 
540 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.29 
 
 
554 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.29 
 
 
554 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
553 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  33.97 
 
 
570 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.81 
 
 
553 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.18 
 
 
553 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  36.76 
 
 
545 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  33.97 
 
 
580 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  31.58 
 
 
271 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.18 
 
 
552 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  39.39 
 
 
543 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.18 
 
 
552 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  34.26 
 
 
539 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 
597 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  38.5 
 
 
258 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.49 
 
 
541 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.81 
 
 
550 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  35.18 
 
 
252 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  35.47 
 
 
609 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 
584 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  34.35 
 
 
278 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  36.48 
 
 
224 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  34.26 
 
 
514 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
255 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
255 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
255 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
581 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  35.35 
 
 
536 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
255 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  36.79 
 
 
255 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  37.84 
 
 
459 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
255 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  34.87 
 
 
255 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  35.07 
 
 
559 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  36.19 
 
 
515 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.48 
 
 
597 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  34.12 
 
 
552 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  40.32 
 
 
255 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  33.96 
 
 
531 aa  121  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
255 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
330 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  33.01 
 
 
569 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>