More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1427 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 345 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  82.95 
 
 		 330 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  51.69 
 
 		 313 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0764  60 kDa inner membrane insertion protein  39.66 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.44 
 
 		 539 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  38.53 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.05 
 
 		 532 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.68 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1422  60 kDa inner membrane insertion protein  38.11 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  35.86 
 
 		 542 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  39.63 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.63 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.58 
 
 		 532 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.76 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  38.18 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  37.02 
 
 		 566 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  36.11 
 
 		 547 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  38.46 
 
 		 553 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  38.25 
 
 		 548 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  38.94 
 
 		 541 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.05 
 
 		 531 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  38.14 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  38.64 
 
 		 536 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  36.16 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  38.5 
 
 		 541 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  39.04 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.74 
 
 		 556 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  38.5 
 
 		 541 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.04 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.75 
 
 		 530 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  36.6 
 
 		 534 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  38.16 
 
 		 528 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  38.5 
 
 		 541 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 554 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 554 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  36 
 
 		 552 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.2 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  38.5 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.76 
 
 		 528 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  37.61 
 
 		 541 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.76 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.87 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  37.17 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  37.17 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  35.32 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  37.17 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  34.33 
 
 		 543 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  36.02 
 
 		 545 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  38.57 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.67 
 
 		 553 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.05 
 
 		 526 aa  142  8e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  39.35 
 
 		 557 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 558 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  38.46 
 
 		 536 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 557 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  35.84 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  36.02 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  36.33 
 
 		 255 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.67 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  34.82 
 
 		 543 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  37.14 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  35.86 
 
 		 225 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  36.73 
 
 		 542 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  35.98 
 
 		 544 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  35.92 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  35.92 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  35.92 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  35.92 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  35.92 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.47 
 
 		 545 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  35.92 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.65 
 
 		 557 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.78 
 
 		 555 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  39.04 
 
 		 534 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  37.56 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  35.56 
 
 		 570 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  36.33 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.32 
 
 		 567 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  36.96 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  35.51 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>