More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7097 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 358 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  53.91 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  55.08 
 
 		 411 aa  339  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  50.48 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.43 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.97 
 
 		 376 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.2 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  45.68 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.55 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.36 
 
 		 367 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.36 
 
 		 367 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  45.32 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.41 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  35.09 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  34.46 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  39.92 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  32.36 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  35.62 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  37.22 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  34.88 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.05 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  31.89 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  37.06 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  34.92 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  33.73 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  32.37 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  34.4 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  35.32 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.81 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  29.78 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  32.42 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  29.45 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  34.47 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.48 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  30.84 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  31.89 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  31.75 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  28.57 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.57 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  33.76 
 
 		 266 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  32.92 
 
 		 278 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  29.2 
 
 		 551 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  34.81 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  32.54 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  29.77 
 
 		 257 aa  106  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.81 
 
 		 567 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  43.59 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  29.1 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  30.71 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  42.74 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.88 
 
 		 541 aa  97.1  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  27.31 
 
 		 255 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  26.33 
 
 		 281 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  27.06 
 
 		 255 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.46 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  40.68 
 
 		 545 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 560 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  26.36 
 
 		 217 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 560 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  27.86 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  27.06 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  27.06 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  27.06 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 560 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  27.86 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  27.06 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 		 626 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  27.06 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 		 560 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  27.86 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  41.12 
 
 		 541 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  27.45 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  25.88 
 
 		 255 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  41.12 
 
 		 541 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  26.56 
 
 		 542 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 541 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  41.12 
 
 		 541 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  41.12 
 
 		 541 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  25.67 
 
 		 291 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  26.32 
 
 		 258 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  28.24 
 
 		 260 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  27.86 
 
 		 260 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.22 
 
 		 560 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  40.2 
 
 		 541 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  40.19 
 
 		 541 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  24.81 
 
 		 256 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  26.67 
 
 		 255 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  39.25 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.59 
 
 		 563 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  39.25 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.98 
 
 		 567 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  25.66 
 
 		 545 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.94 
 
 		 575 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  39.25 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  26.18 
 
 		 260 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  28.14 
 
 		 260 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.44 
 
 		 249 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  25.78 
 
 		 557 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  39.25 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  25.65 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>