More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1908 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.19 
 
 
376 aa  294  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.93 
 
 
367 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.93 
 
 
367 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.93 
 
 
367 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  50.18 
 
 
411 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  49.32 
 
 
390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.82 
 
 
374 aa  285  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.56 
 
 
366 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  45.32 
 
 
358 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  42.14 
 
 
346 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  40.21 
 
 
385 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.46 
 
 
385 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  36.07 
 
 
370 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  35.71 
 
 
338 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  35.56 
 
 
461 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  36.3 
 
 
462 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  31.87 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  32.51 
 
 
308 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  32.13 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  32 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  33.73 
 
 
315 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 
363 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  31.48 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.25 
 
 
314 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  29.3 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  29.21 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  31.23 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  29.33 
 
 
365 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  30.58 
 
 
366 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  30.4 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  30.62 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  28.26 
 
 
314 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  31.27 
 
 
275 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  28.22 
 
 
324 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  33.58 
 
 
332 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  30.45 
 
 
337 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.46 
 
 
384 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  28 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  31.18 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  25.99 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  25.63 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  27.64 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  25.3 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  40.2 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  26.27 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  28.45 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  38.05 
 
 
628 aa  83.2  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  25.26 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.11 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  50.77 
 
 
515 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.59 
 
 
626 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.2 
 
 
544 aa  79  0.00000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  39.08 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  36.78 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  36.78 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  36.44 
 
 
542 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 
571 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.13 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  26.18 
 
 
566 aa  75.9  0.0000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.52 
 
 
557 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  36.78 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.63 
 
 
526 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  32.2 
 
 
539 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.63 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.82 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.11 
 
 
606 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.1 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.09 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  22.71 
 
 
556 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.46 
 
 
517 aa  72  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  25.19 
 
 
570 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_910  preprotein translocase YidC subunit  31.91 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00061315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  25 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  35.63 
 
 
514 aa  72  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.46 
 
 
518 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  33.94 
 
 
604 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  32.76 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 
555 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.86 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  24.44 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  25.73 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.45 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.14 
 
 
628 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  27.47 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  23.69 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  33.9 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  24.07 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 
536 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  23.36 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.56 
 
 
531 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  24.58 
 
 
570 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  36.46 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 
554 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 
554 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  34.48 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  23.85 
 
 
580 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  31.9 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>