More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0881 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
514 aa  1038    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  38.12 
 
 
515 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.15 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.88 
 
 
518 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 
528 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 
530 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.34 
 
 
517 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.09 
 
 
530 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.77 
 
 
532 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.95 
 
 
526 aa  230  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.66 
 
 
531 aa  228  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.8 
 
 
539 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  41.38 
 
 
552 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.87 
 
 
575 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.84 
 
 
550 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.08 
 
 
553 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
557 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.98 
 
 
558 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  43.16 
 
 
536 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.56 
 
 
553 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  45.22 
 
 
562 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.73 
 
 
555 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.56 
 
 
555 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.24 
 
 
554 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.22 
 
 
563 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.78 
 
 
560 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.74 
 
 
560 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.24 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.74 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.42 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.74 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.3 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.74 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.52 
 
 
567 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.74 
 
 
554 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.58 
 
 
555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.3 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.42 
 
 
552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.74 
 
 
552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  38.11 
 
 
537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.74 
 
 
552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  45.58 
 
 
556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  37.83 
 
 
536 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.3 
 
 
578 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.3 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  28.1 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.54 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  37.13 
 
 
528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  43.42 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.17 
 
 
536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.61 
 
 
581 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  37.37 
 
 
531 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  40.79 
 
 
542 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  46.22 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  37.54 
 
 
548 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  40.52 
 
 
557 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.74 
 
 
557 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  41.23 
 
 
547 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  43.1 
 
 
570 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  42.11 
 
 
545 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  43.56 
 
 
609 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  42.29 
 
 
571 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  39.45 
 
 
530 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  40.25 
 
 
614 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  45.73 
 
 
534 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  42.92 
 
 
536 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.91 
 
 
607 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  37.97 
 
 
569 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  42.62 
 
 
553 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
610 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
610 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.69 
 
 
597 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  36.62 
 
 
624 aa  190  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  40.08 
 
 
600 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  43.67 
 
 
557 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  39.51 
 
 
616 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  35.92 
 
 
605 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  44.74 
 
 
567 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  39.51 
 
 
616 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.08 
 
 
541 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 
559 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  41.3 
 
 
553 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  40.25 
 
 
617 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.33 
 
 
620 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  34.77 
 
 
565 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.82 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.59 
 
 
632 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 
544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  31.78 
 
 
528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  31.78 
 
 
528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.3 
 
 
597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  44.54 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.68 
 
 
566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  38.46 
 
 
604 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>