More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2731 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
334 aa  688    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  69.88 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  41.98 
 
 
314 aa  248  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  41.64 
 
 
365 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.09 
 
 
363 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  42.66 
 
 
315 aa  226  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  38.58 
 
 
337 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  36.92 
 
 
324 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  37.43 
 
 
324 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  38.62 
 
 
350 aa  212  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.6 
 
 
384 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  36.53 
 
 
366 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  36.73 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  39.43 
 
 
382 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  35.11 
 
 
308 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.69 
 
 
385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  33.14 
 
 
351 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  35.87 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  35.79 
 
 
318 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  33.54 
 
 
366 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  34.29 
 
 
315 aa  175  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  32.62 
 
 
316 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  31.86 
 
 
370 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  35.29 
 
 
461 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  33.58 
 
 
462 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  32.48 
 
 
266 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.1 
 
 
314 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  33.09 
 
 
338 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  32.14 
 
 
358 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  30.29 
 
 
335 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  31.49 
 
 
346 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.72 
 
 
366 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.9 
 
 
376 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.49 
 
 
367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.56 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.77 
 
 
411 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  30.1 
 
 
385 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.27 
 
 
390 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.87 
 
 
287 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
367 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
367 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.19 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.2 
 
 
577 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.37 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.91 
 
 
584 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.11 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.27 
 
 
600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  30.63 
 
 
268 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.58 
 
 
541 aa  109  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.29 
 
 
541 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 
544 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  31.4 
 
 
271 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.48 
 
 
542 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.14 
 
 
557 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.14 
 
 
536 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.63 
 
 
581 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  32.24 
 
 
231 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  29.11 
 
 
217 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.74 
 
 
560 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.84 
 
 
541 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.82 
 
 
539 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.11 
 
 
607 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.05 
 
 
542 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  29.02 
 
 
628 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.85 
 
 
532 aa  102  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.84 
 
 
608 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.29 
 
 
540 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  32.29 
 
 
540 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  28.4 
 
 
543 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  38.17 
 
 
459 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.25 
 
 
628 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.42 
 
 
547 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 
597 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.7 
 
 
553 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  28.98 
 
 
281 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  29.12 
 
 
257 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.36 
 
 
635 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  28.09 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 
518 aa  99.4  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.75 
 
 
597 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 
589 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 
261 aa  99  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.62 
 
 
560 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.62 
 
 
560 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.62 
 
 
560 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
622 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.62 
 
 
560 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  31.05 
 
 
229 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  27.73 
 
 
425 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  28.24 
 
 
566 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.93 
 
 
597 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  31.42 
 
 
609 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  31 
 
 
548 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
626 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  37.88 
 
 
246 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.63 
 
 
558 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.63 
 
 
558 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 
223 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.63 
 
 
558 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.38 
 
 
578 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>