More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2751 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
266 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  68.28 
 
 
275 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  60.08 
 
 
324 aa  342  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  61.07 
 
 
324 aa  341  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  47.86 
 
 
332 aa  245  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  42.86 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.86 
 
 
363 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  41.29 
 
 
337 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  40.77 
 
 
314 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  44.35 
 
 
384 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  40.48 
 
 
315 aa  221  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  42.02 
 
 
350 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  41.11 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  42.48 
 
 
382 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  34.42 
 
 
328 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  33.21 
 
 
334 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  37.64 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  35.21 
 
 
370 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  38.49 
 
 
315 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  35.29 
 
 
308 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  34.27 
 
 
335 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  35.07 
 
 
462 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  35.38 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.76 
 
 
385 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.27 
 
 
314 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  35.16 
 
 
316 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  34.7 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  34.88 
 
 
351 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  33.09 
 
 
366 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.71 
 
 
366 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 
367 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 
367 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.3 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.96 
 
 
374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.89 
 
 
411 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.34 
 
 
390 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  36.36 
 
 
346 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  33.76 
 
 
358 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.23 
 
 
287 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  35.97 
 
 
233 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.2 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  31.6 
 
 
385 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.74 
 
 
541 aa  112  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  30.59 
 
 
570 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.44 
 
 
541 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.69 
 
 
541 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.16 
 
 
566 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  30.83 
 
 
345 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
581 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  27.78 
 
 
557 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  29.53 
 
 
545 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
557 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  30.13 
 
 
330 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  32.44 
 
 
540 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.44 
 
 
540 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.8 
 
 
564 aa  99  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.65 
 
 
555 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.57 
 
 
278 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 
543 aa  99  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  29.02 
 
 
551 aa  98.6  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.88 
 
 
553 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.32 
 
 
565 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 
626 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.89 
 
 
553 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
560 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  30.13 
 
 
548 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
560 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.51 
 
 
560 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
560 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.07 
 
 
560 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
544 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.19 
 
 
578 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
517 aa  97.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
543 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.99 
 
 
554 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.99 
 
 
554 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.33 
 
 
567 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.94 
 
 
543 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 
595 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.19 
 
 
578 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.56 
 
 
536 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.19 
 
 
575 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  29.33 
 
 
562 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
545 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  27.68 
 
 
542 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  29.6 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.69 
 
 
539 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  29.15 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  26.87 
 
 
547 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.36 
 
 
553 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.97 
 
 
555 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  28.19 
 
 
559 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  28.44 
 
 
255 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.2 
 
 
532 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.57 
 
 
608 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  28.63 
 
 
562 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
628 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>