More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4590 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 370 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  88.36 
 
 		 338 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  52.88 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.41 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  38.12 
 
 		 461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  40.85 
 
 		 462 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  36.92 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  33.77 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.37 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.16 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.61 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  34.85 
 
 		 315 aa  186  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  35.47 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  35.14 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  33.43 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  34.15 
 
 		 314 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  36.2 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  32.36 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  31.37 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  36.04 
 
 		 324 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.72 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  34.19 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  35.71 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  31.88 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  34.3 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  32.74 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  30.55 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.14 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  35.21 
 
 		 266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  34.7 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.07 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  34.15 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  30.03 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 		 600 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 		 584 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  32.89 
 
 		 553 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  31.15 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.53 
 
 		 632 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.4 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.28 
 
 		 629 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.76 
 
 		 577 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.28 
 
 		 621 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.48 
 
 		 278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.22 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.96 
 
 		 609 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  33.47 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.27 
 
 		 595 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 		 539 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.99 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  32.9 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 		 553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 		 578 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.02 
 
 		 578 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.19 
 
 		 614 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.02 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  34.23 
 
 		 542 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  31.06 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.92 
 
 		 554 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.92 
 
 		 554 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.9 
 
 		 630 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.14 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.89 
 
 		 621 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  30.32 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  30.16 
 
 		 604 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  30.08 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.9 
 
 		 557 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  30 
 
 		 258 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  30.23 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.28 
 
 		 622 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  31.82 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  30.08 
 
 		 255 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  30.08 
 
 		 255 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  30.08 
 
 		 255 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  30.08 
 
 		 255 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  30.08 
 
 		 255 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.17 
 
 		 616 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.98 
 
 		 608 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  32.29 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.12 
 
 		 609 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.55 
 
 		 542 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.15 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  30.89 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  30.56 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.14 
 
 		 626 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.46 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  28.92 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 		 563 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  31.7 
 
 		 609 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  32.14 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  29.11 
 
 		 255 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  30.36 
 
 		 624 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  29.82 
 
 		 556 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>