More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 
346 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  53.59 
 
 
358 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.51 
 
 
376 aa  295  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  46.35 
 
 
390 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.5 
 
 
374 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.47 
 
 
367 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  46.23 
 
 
411 aa  282  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.5 
 
 
367 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.5 
 
 
367 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.51 
 
 
366 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  42.78 
 
 
385 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.7 
 
 
287 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.72 
 
 
385 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  35.14 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  35.94 
 
 
461 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  35.08 
 
 
462 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  38.35 
 
 
338 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 
363 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  30.67 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  34.77 
 
 
351 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  33.12 
 
 
308 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  32.65 
 
 
328 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  31.66 
 
 
334 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  32.32 
 
 
315 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  29.87 
 
 
365 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  33.43 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  30.89 
 
 
314 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.91 
 
 
314 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  31.02 
 
 
315 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  33.1 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  32.94 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  34.63 
 
 
318 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  35.9 
 
 
350 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  30.9 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  30.21 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.25 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  37.24 
 
 
266 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  29.94 
 
 
332 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  35.34 
 
 
275 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  33.75 
 
 
382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  27.92 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.39 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.33 
 
 
309 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.68 
 
 
567 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  27.24 
 
 
551 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.56 
 
 
541 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  29.07 
 
 
341 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.87 
 
 
541 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  27.27 
 
 
557 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.52 
 
 
541 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  27.88 
 
 
545 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.2 
 
 
575 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  31.98 
 
 
268 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 
517 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.92 
 
 
532 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  29.2 
 
 
570 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  28.32 
 
 
541 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  29.18 
 
 
545 aa  99.8  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.64 
 
 
600 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  31.39 
 
 
313 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.77 
 
 
540 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  24.29 
 
 
543 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
560 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
560 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.48 
 
 
560 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 
544 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
560 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  26.99 
 
 
542 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
560 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  26.77 
 
 
540 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  25.65 
 
 
545 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.57 
 
 
563 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  28.26 
 
 
566 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  26.21 
 
 
541 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.9 
 
 
581 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  26.32 
 
 
544 aa  95.9  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  26.09 
 
 
256 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.79 
 
 
567 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  25.1 
 
 
562 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.75 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  28.3 
 
 
556 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  28.3 
 
 
556 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  26 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  27.56 
 
 
542 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.45 
 
 
584 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  26.92 
 
 
291 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  26.49 
 
 
257 aa  94  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.29 
 
 
566 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  27.76 
 
 
547 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  32.37 
 
 
536 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.76 
 
 
553 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  25.81 
 
 
551 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.59 
 
 
564 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.9 
 
 
557 aa  92.8  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  26.03 
 
 
425 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 
518 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  29.78 
 
 
246 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.32 
 
 
553 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.05 
 
 
565 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  25 
 
 
578 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>