More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3488 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  39.52 
 
 
291 aa  215  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  36.97 
 
 
341 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.78 
 
 
553 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  31.52 
 
 
223 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  32.26 
 
 
313 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  32.02 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  31.47 
 
 
330 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  32 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.22 
 
 
550 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  32.12 
 
 
261 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  29.59 
 
 
534 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  30.04 
 
 
308 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.14 
 
 
278 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  28.84 
 
 
536 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  26.39 
 
 
300 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  33.09 
 
 
534 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
544 aa  122  5e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  29.68 
 
 
229 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  32.39 
 
 
351 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  31.27 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  44.55 
 
 
539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  31 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  31.52 
 
 
224 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  31.98 
 
 
217 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.48 
 
 
559 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  29.86 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0764  60 kDa inner membrane insertion protein  33.21 
 
 
311 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  29.92 
 
 
548 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  29.62 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  29.82 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  25.25 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  28.72 
 
 
318 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  56.57 
 
 
459 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.25 
 
 
584 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 
213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  28.52 
 
 
556 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 
607 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  55.81 
 
 
454 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  25.65 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.6 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  27.92 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  27.92 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  27.92 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  27.92 
 
 
260 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  27.92 
 
 
260 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  41.82 
 
 
542 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  27.9 
 
 
604 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  31.02 
 
 
584 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  27.56 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  53.68 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.73 
 
 
610 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.73 
 
 
610 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  25.37 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  49.02 
 
 
548 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  27.96 
 
 
260 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  27.56 
 
 
260 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  27.4 
 
 
358 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.02 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  26.86 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  43.59 
 
 
607 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  27.21 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.94 
 
 
411 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.57 
 
 
597 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.71 
 
 
584 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.15 
 
 
541 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.91 
 
 
577 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  50.53 
 
 
249 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.53 
 
 
366 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  50 
 
 
545 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.04 
 
 
548 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.04 
 
 
548 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.04 
 
 
548 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.04 
 
 
548 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.51 
 
 
626 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.04 
 
 
548 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  27.4 
 
 
257 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  26.86 
 
 
425 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.82 
 
 
565 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  27.24 
 
 
589 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  28.92 
 
 
628 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 
609 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.82 
 
 
565 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  28.98 
 
 
334 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  27.34 
 
 
315 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  42.73 
 
 
542 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  25.97 
 
 
346 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.35 
 
 
595 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.92 
 
 
367 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  45.28 
 
 
544 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.6 
 
 
385 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.92 
 
 
367 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.92 
 
 
367 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>