More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4367 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  64.25 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  55.5 
 
 		 300 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  57.08 
 
 		 231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  50.47 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.02 
 
 		 517 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.55 
 
 		 518 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  47.32 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.02 
 
 		 532 aa  171  9e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  46.2 
 
 		 532 aa  170  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  46.77 
 
 		 556 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.65 
 
 		 530 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.65 
 
 		 528 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.18 
 
 		 530 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  42.27 
 
 		 542 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.09 
 
 		 531 aa  161  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.23 
 
 		 526 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  42.08 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  41.05 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.63 
 
 		 541 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  41.05 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  41.55 
 
 		 255 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  41.1 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  42.41 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  41.55 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  42.93 
 
 		 536 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  47.31 
 
 		 541 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  41.1 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  41.1 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  41.1 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  40.28 
 
 		 537 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  41.1 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  45.6 
 
 		 540 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  46.41 
 
 		 543 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  41.1 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  46.52 
 
 		 566 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.99 
 
 		 540 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  46.77 
 
 		 544 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  46.77 
 
 		 544 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  39.71 
 
 		 562 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.45 
 
 		 541 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  40.09 
 
 		 528 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  42.25 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  46.77 
 
 		 542 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  36.7 
 
 		 539 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  40.64 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  39.47 
 
 		 536 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  44.16 
 
 		 672 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  42.64 
 
 		 583 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  46.24 
 
 		 541 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.41 
 
 		 541 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  46.24 
 
 		 541 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.42 
 
 		 567 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.32 
 
 		 536 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  46.24 
 
 		 545 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  46.77 
 
 		 541 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  44.57 
 
 		 531 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  45.7 
 
 		 541 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  39.63 
 
 		 345 aa  151  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  41.94 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  45.7 
 
 		 541 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  47.54 
 
 		 542 aa  151  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.07 
 
 		 567 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.39 
 
 		 581 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  45.7 
 
 		 541 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  36.89 
 
 		 330 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  45.16 
 
 		 541 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  45.16 
 
 		 541 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  45.16 
 
 		 541 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  40.32 
 
 		 556 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  40.32 
 
 		 556 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  42.49 
 
 		 536 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 		 575 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  45.16 
 
 		 541 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.3 
 
 		 560 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.3 
 
 		 560 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  40.09 
 
 		 553 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.3 
 
 		 560 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.3 
 
 		 560 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  43.55 
 
 		 551 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  37.55 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  41.62 
 
 		 542 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  36.74 
 
 		 548 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  36.16 
 
 		 553 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  41.84 
 
 		 559 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  40.22 
 
 		 545 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  41.58 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  39.89 
 
 		 557 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  41 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.67 
 
 		 553 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.62 
 
 		 557 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.89 
 
 		 554 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.89 
 
 		 554 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  41.99 
 
 		 543 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.86 
 
 		 249 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  38.38 
 
 		 547 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.08 
 
 		 560 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.49 
 
 		 552 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.49 
 
 		 552 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  33.91 
 
 		 278 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>