More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4959 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  46.88 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  48.39 
 
 
229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  44.14 
 
 
300 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  40.68 
 
 
225 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.72 
 
 
531 aa  152  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.1 
 
 
518 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.27 
 
 
231 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.74 
 
 
532 aa  150  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  42.48 
 
 
224 aa  149  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  36.96 
 
 
213 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.95 
 
 
517 aa  144  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  35.32 
 
 
268 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  36.52 
 
 
219 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  36 
 
 
542 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  37.78 
 
 
553 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.56 
 
 
532 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  40.47 
 
 
549 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.11 
 
 
536 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
526 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  36.94 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  35.02 
 
 
539 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.67 
 
 
530 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.67 
 
 
528 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.67 
 
 
530 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  34.48 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  35.61 
 
 
536 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
554 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
554 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
557 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  32.65 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  35.78 
 
 
548 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  36.45 
 
 
556 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  36.89 
 
 
556 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 
550 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  36.89 
 
 
556 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  33.2 
 
 
607 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.23 
 
 
552 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.23 
 
 
553 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.23 
 
 
552 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  35.35 
 
 
536 aa  128  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.78 
 
 
553 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.19 
 
 
552 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
589 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.19 
 
 
552 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  33.49 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  33.18 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  38.26 
 
 
542 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.51 
 
 
557 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  35.45 
 
 
531 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.58 
 
 
537 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.31 
 
 
555 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.41 
 
 
544 aa  125  8.000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  33.83 
 
 
315 aa  124  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.32 
 
 
559 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  35.35 
 
 
546 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  35.35 
 
 
545 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.2 
 
 
555 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  35.35 
 
 
546 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  37.56 
 
 
583 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  35.71 
 
 
562 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.82 
 
 
581 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  30.37 
 
 
291 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.41 
 
 
540 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  36.41 
 
 
540 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.87 
 
 
555 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  31.17 
 
 
313 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  35.81 
 
 
528 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.7 
 
 
567 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.74 
 
 
567 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 
533 aa  122  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.98 
 
 
548 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.91 
 
 
541 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.47 
 
 
541 aa  121  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  35.12 
 
 
545 aa  121  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  33.62 
 
 
584 aa  121  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.33 
 
 
600 aa  121  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.9 
 
 
553 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  30.58 
 
 
330 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  32.75 
 
 
514 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  31.44 
 
 
628 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0764  60 kDa inner membrane insertion protein  36.16 
 
 
311 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  36.22 
 
 
314 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  35.84 
 
 
542 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.24 
 
 
541 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>