More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3213 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  52.8 
 
 
246 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  39.81 
 
 
542 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.01 
 
 
575 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.66 
 
 
532 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.81 
 
 
309 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.1 
 
 
517 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.13 
 
 
518 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  38.86 
 
 
543 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.07 
 
 
567 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.1 
 
 
531 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.1 
 
 
533 aa  155  5.0000000000000005e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  39.06 
 
 
551 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  36.24 
 
 
539 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  37.56 
 
 
557 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  39.3 
 
 
547 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.18 
 
 
546 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.18 
 
 
546 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.18 
 
 
546 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 
541 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
554 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
554 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
553 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
553 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
545 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
552 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
543 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
552 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
550 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 
544 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  40.98 
 
 
541 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  39.22 
 
 
544 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.2 
 
 
543 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.45 
 
 
555 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  39.02 
 
 
545 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
548 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
560 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
548 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
548 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.11 
 
 
557 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
548 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 
548 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
558 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
544 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.2 
 
 
543 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.69 
 
 
548 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.07 
 
 
532 aa  150  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.41 
 
 
563 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
560 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  39.51 
 
 
542 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
560 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.62 
 
 
552 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.07 
 
 
553 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  39.51 
 
 
541 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  39.51 
 
 
541 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  31.49 
 
 
300 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.1 
 
 
552 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
560 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 
554 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.59 
 
 
554 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
560 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  39.51 
 
 
541 aa  148  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  39.02 
 
 
541 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  35.94 
 
 
562 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  35.14 
 
 
545 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  39.02 
 
 
541 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  37.26 
 
 
548 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  39.51 
 
 
541 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  40.49 
 
 
542 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  39.51 
 
 
541 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  39.02 
 
 
541 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  37.31 
 
 
536 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.1 
 
 
566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  36.79 
 
 
514 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  36.22 
 
 
556 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  38.92 
 
 
552 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  39.35 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  39.35 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  39.35 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  36.22 
 
 
556 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  39.35 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  39.35 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  35.14 
 
 
570 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  40.1 
 
 
541 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  38.39 
 
 
566 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>