More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 
257 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  66.15 
 
 
261 aa  362  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  62.79 
 
 
257 aa  345  6e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1366  60 kDa inner membrane insertion protein  43.02 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  32.31 
 
 
268 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 
209 aa  125  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.7 
 
 
552 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  30.94 
 
 
281 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  29.74 
 
 
313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.63 
 
 
575 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.6 
 
 
539 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  33.03 
 
 
271 aa  118  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  34.52 
 
 
459 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  31.28 
 
 
545 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.48 
 
 
541 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  32.65 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  37.02 
 
 
255 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.3 
 
 
787 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.43 
 
 
544 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  32.09 
 
 
515 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  35.91 
 
 
255 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  35.91 
 
 
255 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  35.91 
 
 
255 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  28 
 
 
547 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  35.91 
 
 
255 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  35.91 
 
 
255 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.28 
 
 
544 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  33.82 
 
 
542 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
567 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  31.25 
 
 
542 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  31.16 
 
 
553 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  31.06 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  36.24 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  30.14 
 
 
225 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  30.21 
 
 
330 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  35.45 
 
 
255 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  36.23 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.19 
 
 
545 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.19 
 
 
543 aa  111  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.19 
 
 
543 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  25.85 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.28 
 
 
541 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.28 
 
 
544 aa  111  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.73 
 
 
541 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 
546 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 
546 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 
546 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
584 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.24 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  31.25 
 
 
541 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.91 
 
 
517 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30.77 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  31.25 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  31.25 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  31.25 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.38 
 
 
454 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  31.25 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  31.25 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  28.71 
 
 
536 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  34.56 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  29.96 
 
 
562 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  32.83 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  33.18 
 
 
531 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  27.56 
 
 
291 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  30.77 
 
 
542 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.46 
 
 
581 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.39 
 
 
577 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  35.27 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  29.82 
 
 
548 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.97 
 
 
578 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  27.67 
 
 
425 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
543 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  27.63 
 
 
566 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  31.63 
 
 
223 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  29.82 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  30.94 
 
 
260 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.91 
 
 
560 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.29 
 
 
541 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.36 
 
 
544 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  29.81 
 
 
541 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
548 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  30.94 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  28.5 
 
 
545 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  30.94 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.89 
 
 
600 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  31.88 
 
 
217 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  31.65 
 
 
229 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  30.94 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.97 
 
 
578 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  28.43 
 
 
556 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.36 
 
 
548 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 
560 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 
363 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>