More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2760 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
341 aa  694    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  35.82 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  36.36 
 
 
281 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.62 
 
 
532 aa  143  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.46 
 
 
517 aa  142  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.93 
 
 
531 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.57 
 
 
518 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.33 
 
 
532 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.48 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 
545 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.34 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.48 
 
 
530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.98 
 
 
544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  34.13 
 
 
514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  31.34 
 
 
316 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.74 
 
 
544 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.74 
 
 
543 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.94 
 
 
540 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.26 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 
541 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.42 
 
 
528 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  31.94 
 
 
540 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 
548 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 
548 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 
548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 
548 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 
548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
548 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  30.69 
 
 
260 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  30.69 
 
 
260 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
546 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
546 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  30.69 
 
 
260 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.48 
 
 
541 aa  126  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.26 
 
 
546 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  30.08 
 
 
308 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.37 
 
 
543 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
543 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.04 
 
 
553 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  30.69 
 
 
260 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  30.69 
 
 
260 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  32.7 
 
 
330 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  30.46 
 
 
628 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
582 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  32.4 
 
 
600 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.42 
 
 
541 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.35 
 
 
607 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  33.98 
 
 
252 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
345 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.33 
 
 
249 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.32 
 
 
344 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.04 
 
 
238 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.41 
 
 
238 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  33.11 
 
 
268 aa  122  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  32.06 
 
 
556 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  30.31 
 
 
614 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  32.57 
 
 
261 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  30.04 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  30.42 
 
 
260 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  29.28 
 
 
260 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  30.12 
 
 
552 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.64 
 
 
539 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  32.13 
 
 
559 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.5 
 
 
533 aa  119  7e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  30.08 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  33.19 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.52 
 
 
565 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  29.3 
 
 
462 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  29.24 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  29.6 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  30.4 
 
 
616 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.94 
 
 
550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  31.13 
 
 
536 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
597 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  29.54 
 
 
257 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.65 
 
 
541 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  30.4 
 
 
616 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  31.03 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.53 
 
 
597 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30.27 
 
 
541 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.3 
 
 
566 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.52 
 
 
558 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  29.93 
 
 
286 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.86 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  31.52 
 
 
257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>