More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1536 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  85.14 
 
 		 249 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  57.03 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  55.86 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  55.33 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  54.69 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  54.69 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  54.69 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  54.69 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  54.69 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  54.3 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  53.91 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  52.73 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  48.18 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  49.78 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  49.56 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  49.56 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  49.12 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  48.67 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  48.67 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  48.67 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  48.66 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  48.67 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  49.12 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  47.79 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  47.03 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  42.15 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  40.77 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  39.24 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  37.83 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  40.67 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  35.17 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  35.98 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  38.94 
 
 		 514 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  41.76 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.89 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.09 
 
 		 540 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  39.5 
 
 		 541 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.14 
 
 		 575 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  39 
 
 		 541 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  37.09 
 
 		 540 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.44 
 
 		 565 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  39 
 
 		 541 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.24 
 
 		 565 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  39 
 
 		 541 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  39 
 
 		 541 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  37.56 
 
 		 542 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.09 
 
 		 541 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  35.68 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  36.36 
 
 		 545 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  36.19 
 
 		 566 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 		 542 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  42.78 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.04 
 
 		 517 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.7 
 
 		 532 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 		 541 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  36.4 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.65 
 
 		 526 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  37 
 
 		 542 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.75 
 
 		 541 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  37.69 
 
 		 541 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.47 
 
 		 556 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  37.69 
 
 		 541 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  37.81 
 
 		 551 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  37.69 
 
 		 541 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  37.69 
 
 		 541 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  37 
 
 		 552 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.65 
 
 		 518 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  35 
 
 		 553 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  33.64 
 
 		 548 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  36.36 
 
 		 543 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.44 
 
 		 530 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.44 
 
 		 528 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  35.61 
 
 		 545 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 		 543 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  36 
 
 		 544 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.67 
 
 		 533 aa  130  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.58 
 
 		 544 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  33.8 
 
 		 543 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  35.55 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.97 
 
 		 530 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.67 
 
 		 231 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  35.35 
 
 		 541 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.51 
 
 		 532 aa  130  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  34.31 
 
 		 545 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 560 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.68 
 
 		 560 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 560 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.27 
 
 		 554 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.27 
 
 		 554 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 560 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 560 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  34.22 
 
 		 562 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  38 
 
 		 225 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 		 543 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.93 
 
 		 543 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.8 
 
 		 545 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  37.32 
 
 		 548 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.32 
 
 		 548 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 		 557 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>