More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1942 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  57.58 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  52.21 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  54.58 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  51.95 
 
 		 286 aa  255  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  48.16 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  43.98 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  45.69 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  45.69 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  45.69 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  45.69 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  45.69 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  44.83 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  46.43 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  42.98 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  45.26 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  45.98 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  42.15 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.92 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  41.38 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  42.63 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  42.86 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  41 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  41 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  41 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  41 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  41.84 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  41.49 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  41.08 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  40.66 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  39.75 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  39.73 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  38.49 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  38.86 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.82 
 
 		 517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  36.07 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.62 
 
 		 344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  33.96 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.18 
 
 		 531 aa  125  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.86 
 
 		 532 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  35.71 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.69 
 
 		 518 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  36.46 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  31.82 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  31.68 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  32.88 
 
 		 345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.41 
 
 		 530 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.37 
 
 		 526 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  35 
 
 		 542 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.94 
 
 		 530 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.05 
 
 		 532 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.56 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 528 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  35.23 
 
 		 539 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.33 
 
 		 454 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.72 
 
 		 537 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  31.44 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  34.5 
 
 		 607 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  33.03 
 
 		 583 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  35.23 
 
 		 536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  35.11 
 
 		 515 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  34.43 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  29.96 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.17 
 
 		 560 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  35.1 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.54 
 
 		 575 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.73 
 
 		 536 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  32.65 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 		 541 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  30.1 
 
 		 556 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 		 553 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  35.29 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  36.06 
 
 		 534 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  34.95 
 
 		 541 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  32.21 
 
 		 548 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  33.17 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.92 
 
 		 554 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  37.84 
 
 		 536 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  36.41 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.24 
 
 		 597 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.24 
 
 		 554 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  32.21 
 
 		 548 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  30.58 
 
 		 543 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  34.41 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.34 
 
 		 566 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 		 596 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  32.21 
 
 		 548 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.71 
 
 		 560 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.21 
 
 		 548 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  30.37 
 
 		 548 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.71 
 
 		 560 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  33.68 
 
 		 536 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.21 
 
 		 548 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.71 
 
 		 560 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.84 
 
 		 607 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.21 
 
 		 548 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  34.41 
 
 		 541 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  34.41 
 
 		 545 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>