More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2021 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  53.33 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  53.7 
 
 
290 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  53.7 
 
 
290 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  34.5 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  34.15 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  33.6 
 
 
255 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  31.35 
 
 
320 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  31.56 
 
 
305 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  33.87 
 
 
258 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  34.38 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  34.38 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  34.38 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  34.38 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  34.38 
 
 
255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  34.38 
 
 
255 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  32.48 
 
 
316 aa  122  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  33.84 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  31.58 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  34.94 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.43 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  30.3 
 
 
256 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  31.35 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  30 
 
 
344 aa  108  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  33.47 
 
 
269 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  26.91 
 
 
327 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  36.79 
 
 
209 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  30.34 
 
 
291 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  31.11 
 
 
310 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  29.84 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  29.85 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 
223 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
546 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
546 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
546 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  33.82 
 
 
225 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  30.43 
 
 
257 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.08 
 
 
541 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  28.88 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  29.44 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
543 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  30.94 
 
 
566 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.41 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
544 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.41 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.41 
 
 
548 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.42 
 
 
545 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 
548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 
548 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.8 
 
 
543 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 
548 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 
548 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 
548 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 
548 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
543 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.33 
 
 
540 aa  86.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  29.72 
 
 
540 aa  85.9  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  28.27 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.66 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  27.34 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 
533 aa  84  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.69 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  29.52 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.69 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 
530 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  29 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  29 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  32.14 
 
 
607 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.3 
 
 
542 aa  82  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  29.53 
 
 
341 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  29 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.74 
 
 
555 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  30.69 
 
 
583 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  29.9 
 
 
570 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  27.71 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.28 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  27.83 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.23 
 
 
555 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  32.06 
 
 
544 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  28.14 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>