More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1223 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 316 aa  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  38.23 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  37.82 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  40 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  40.32 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  35.94 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  36.88 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  33.72 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  32.85 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  32.93 
 
 		 290 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  32.93 
 
 		 290 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  31.47 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  31.44 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  32.16 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.9 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  31.37 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  30.98 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  30.98 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  30.98 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  30.98 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  30.98 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  34.17 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  30.98 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  30.2 
 
 		 255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  30.2 
 
 		 255 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  30.43 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  29.6 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  30.15 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  32.87 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  29.6 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  29.6 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  29.6 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  29.2 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  27.99 
 
 		 260 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  30.47 
 
 		 254 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.4 
 
 		 532 aa  99.4  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  30.8 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  29.44 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  27.98 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  28.29 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  29.03 
 
 		 260 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.57 
 
 		 531 aa  96.3  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  27.87 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  26.58 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.71 
 
 		 517 aa  94  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.45 
 
 		 518 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  28.36 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.65 
 
 		 548 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.46 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.66 
 
 		 532 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  27.31 
 
 		 553 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.74 
 
 		 623 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.74 
 
 		 623 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.35 
 
 		 541 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  31.2 
 
 		 541 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  33.02 
 
 		 225 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 		 546 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  31.2 
 
 		 541 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 		 546 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 		 546 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  29.36 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.79 
 
 		 530 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.47 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  34.29 
 
 		 209 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  31.2 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  31.76 
 
 		 542 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  31.82 
 
 		 545 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.36 
 
 		 548 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.08 
 
 		 565 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  29.13 
 
 		 628 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.08 
 
 		 565 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.45 
 
 		 528 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.77 
 
 		 626 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.77 
 
 		 541 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.36 
 
 		 530 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  31.2 
 
 		 541 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.62 
 
 		 551 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  29.41 
 
 		 559 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.31 
 
 		 544 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 		 526 aa  86.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.54 
 
 		 545 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  32.86 
 
 		 531 aa  86.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.91 
 
 		 542 aa  86.3  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.32 
 
 		 223 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>