More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2063 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  54.98 
 
 
286 aa  278  7e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  58.44 
 
 
263 aa  268  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  49.38 
 
 
269 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  48.03 
 
 
291 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  46.22 
 
 
271 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  46.22 
 
 
268 aa  202  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.24 
 
 
249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  39.24 
 
 
252 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  39.18 
 
 
255 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  39.74 
 
 
256 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  38.78 
 
 
255 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  37.96 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  38.37 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  36.86 
 
 
258 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  38.52 
 
 
255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  42.33 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  40.09 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  40.1 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  40.1 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  40.1 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  42.02 
 
 
223 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  41.43 
 
 
260 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
260 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
260 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  38 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  40.95 
 
 
260 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  36.96 
 
 
260 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  39.62 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  34.3 
 
 
345 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  34.02 
 
 
330 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.78 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  41.11 
 
 
225 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  35.58 
 
 
229 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  35.32 
 
 
219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.61 
 
 
532 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.64 
 
 
531 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  34.42 
 
 
583 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.89 
 
 
532 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.09 
 
 
596 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  35.92 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  36.1 
 
 
566 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  42.33 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  42.33 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  42.33 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  42.33 
 
 
541 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  41.8 
 
 
541 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  42.39 
 
 
541 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
518 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  41.71 
 
 
541 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  41.8 
 
 
541 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  41.8 
 
 
541 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  41.71 
 
 
541 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
531 aa  108  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.79 
 
 
567 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.13 
 
 
517 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  32.16 
 
 
341 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  35.29 
 
 
542 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.01 
 
 
238 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  38.38 
 
 
544 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  39.46 
 
 
545 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  37.19 
 
 
546 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.64 
 
 
278 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  39.78 
 
 
542 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 
565 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  37.19 
 
 
546 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  37.19 
 
 
545 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32 
 
 
553 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.71 
 
 
545 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 
565 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.64 
 
 
566 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  40.74 
 
 
541 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.98 
 
 
533 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  36.46 
 
 
552 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  31.56 
 
 
337 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 
313 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
554 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.71 
 
 
543 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  38.1 
 
 
544 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  41.53 
 
 
542 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.89 
 
 
454 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.17 
 
 
541 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  39.25 
 
 
540 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  40 
 
 
543 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.71 
 
 
546 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.71 
 
 
546 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.71 
 
 
546 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.01 
 
 
575 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.85 
 
 
552 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
238 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.25 
 
 
540 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.85 
 
 
553 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.85 
 
 
552 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>