More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1729 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  41.77 
 
 
344 aa  241  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  38.89 
 
 
316 aa  195  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  34.59 
 
 
327 aa  189  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  35.56 
 
 
305 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  32.21 
 
 
320 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  35.16 
 
 
310 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  33.46 
 
 
290 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  31.58 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  31 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  31 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.29 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  35.12 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  34.76 
 
 
256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  38.05 
 
 
255 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  38.54 
 
 
255 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
255 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
255 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
255 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
255 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
255 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
255 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  37.07 
 
 
258 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  36.59 
 
 
255 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  36.59 
 
 
255 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  35.68 
 
 
254 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  30.04 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  35.06 
 
 
263 aa  92  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  30 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  27.23 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.88 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  31.88 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  28.5 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  27.75 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  27.75 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  28.71 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  28.44 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  25 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  28.71 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  28.23 
 
 
545 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  28.71 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 
532 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  28.23 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  27.27 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  27.27 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  27.27 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30.22 
 
 
541 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  29.29 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.22 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.35 
 
 
553 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
542 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
578 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
541 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  30.22 
 
 
541 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
578 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  29.78 
 
 
545 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.23 
 
 
557 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.42 
 
 
518 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30.22 
 
 
541 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 
546 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 
546 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 
546 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  29.44 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.94 
 
 
554 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  29.73 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.94 
 
 
554 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
528 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.23 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.94 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.93 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.41 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
543 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.31 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.41 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  29.2 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.34 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  27.44 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  30.74 
 
 
540 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
543 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
544 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.44 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.44 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.52 
 
 
526 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.44 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.44 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  25.36 
 
 
583 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  29.19 
 
 
545 aa  69.3  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  28.89 
 
 
542 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 
548 aa  68.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  24.77 
 
 
553 aa  69.3  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  28.9 
 
 
539 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.32 
 
 
581 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.24 
 
 
541 aa  68.9  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  26.76 
 
 
552 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.13 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>