More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1789 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  55.17 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  50.56 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  46.22 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  45.56 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  43.16 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.8 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  35.98 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  39.1 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  34.57 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  34.16 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  34.16 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  34.16 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  34.16 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  34.16 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  33.74 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  33.74 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  34.16 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  33.74 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  37.33 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  35.8 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  35.54 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  35.54 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  35.54 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  36.36 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  35.54 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  36.6 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  36.17 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  36.6 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  36.6 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  35.25 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  40.45 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  39.47 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  34.58 
 
 		 583 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  34.27 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  36.15 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  39.89 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  33.76 
 
 		 330 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  33.61 
 
 		 345 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.12 
 
 		 517 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.71 
 
 		 454 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.24 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  31.23 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.14 
 
 		 541 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 		 541 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 		 536 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.22 
 
 		 537 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.13 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  35.83 
 
 		 541 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  35.83 
 
 		 541 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.12 
 
 		 531 aa  112  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  31.75 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 532 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  36.76 
 
 		 459 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.15 
 
 		 532 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.97 
 
 		 518 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.85 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  35.29 
 
 		 541 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.2 
 
 		 566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.83 
 
 		 541 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  35.29 
 
 		 541 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  35.83 
 
 		 541 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 		 540 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.84 
 
 		 533 aa  110  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  35.29 
 
 		 541 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  36.61 
 
 		 540 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  35.29 
 
 		 541 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  35.29 
 
 		 541 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.84 
 
 		 530 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 545 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.84 
 
 		 530 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  37.36 
 
 		 531 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  33.68 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 557 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.78 
 
 		 558 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  32.33 
 
 		 314 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 560 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2411  60 kDa inner membrane insertion protein  38.92 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000768674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 		 542 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  34.05 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  33.51 
 
 		 528 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.64 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.64 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 		 550 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.05 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.59 
 
 		 543 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 		 542 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>