More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0130 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  56.98 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  52.36 
 
 
263 aa  254  9e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  50.57 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  49.19 
 
 
278 aa  238  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  45.06 
 
 
291 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  41.56 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  40.33 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  44.34 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  39.92 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  37.86 
 
 
256 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  37.4 
 
 
252 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.32 
 
 
249 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  36.63 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  37.61 
 
 
257 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  36.4 
 
 
260 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  36.67 
 
 
260 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  35.56 
 
 
260 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  35.56 
 
 
260 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  35.56 
 
 
260 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  33.99 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  35 
 
 
260 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  35 
 
 
260 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  34.58 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  33.33 
 
 
260 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  37.8 
 
 
300 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.71 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  41.11 
 
 
223 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.63 
 
 
238 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.63 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  41.24 
 
 
225 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  34.35 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  35.71 
 
 
219 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  34.44 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  35.75 
 
 
542 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  36.45 
 
 
583 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  40.1 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  37.44 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  33.85 
 
 
536 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  34.87 
 
 
539 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  34.22 
 
 
541 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  34.22 
 
 
541 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  34.22 
 
 
541 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32 
 
 
548 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
541 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  33.69 
 
 
542 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  34.22 
 
 
541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  35.75 
 
 
556 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.6 
 
 
540 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  36.46 
 
 
536 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  33.69 
 
 
542 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.4 
 
 
454 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  35.6 
 
 
540 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  35.98 
 
 
224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  34.22 
 
 
541 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  31.54 
 
 
514 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
541 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 
541 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  33.16 
 
 
541 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 
541 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.22 
 
 
600 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  35.56 
 
 
531 aa  112  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.03 
 
 
541 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 
545 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  31.33 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  31.45 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.84 
 
 
575 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  32.54 
 
 
543 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  36.41 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  38.59 
 
 
546 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  35.57 
 
 
459 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  31.12 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  32.99 
 
 
537 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  38.59 
 
 
545 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  38.59 
 
 
546 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  35.38 
 
 
534 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 
246 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.36 
 
 
566 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  32.62 
 
 
544 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.7 
 
 
546 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.7 
 
 
546 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  32.51 
 
 
257 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.7 
 
 
546 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  31.17 
 
 
278 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 
544 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  34.24 
 
 
551 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  32.6 
 
 
543 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  32.97 
 
 
541 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.46 
 
 
541 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 
545 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>