More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2994 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  97.48 
 
 		 238 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  44.79 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  43.98 
 
 		 258 aa  154  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  42.64 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  43.75 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  42.71 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  43.41 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  41.24 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  40.43 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  35.04 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  40.11 
 
 		 514 aa  145  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  40.96 
 
 		 583 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  39.42 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  37.6 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  38.5 
 
 		 553 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  41.75 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  34.23 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  42.42 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 532 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  39.68 
 
 		 459 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  40.72 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  39.9 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.65 
 
 		 518 aa  134  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 		 553 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  38.94 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  38.86 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  35.62 
 
 		 330 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  45.7 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  39.42 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  40.28 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  39.79 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  35.65 
 
 		 345 aa  131  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.38 
 
 		 344 aa  131  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  41.09 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.18 
 
 		 454 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  39.49 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  34.57 
 
 		 542 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  34.72 
 
 		 557 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  41.15 
 
 		 291 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.94 
 
 		 558 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.97 
 
 		 554 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.97 
 
 		 554 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  35.9 
 
 		 539 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 517 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  35.62 
 
 		 583 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.47 
 
 		 557 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.19 
 
 		 532 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  34.98 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.18 
 
 		 550 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  36.05 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.88 
 
 		 547 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.33 
 
 		 565 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  38.19 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.33 
 
 		 565 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.9 
 
 		 564 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.33 
 
 		 530 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.8 
 
 		 553 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  36.36 
 
 		 556 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.52 
 
 		 555 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  37.7 
 
 		 569 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 		 515 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  37.77 
 
 		 570 aa  124  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  38.92 
 
 		 551 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  37.61 
 
 		 545 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.52 
 
 		 555 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  35.44 
 
 		 570 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.16 
 
 		 575 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 554 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.9 
 
 		 530 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.31 
 
 		 555 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  38.25 
 
 		 569 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  35.52 
 
 		 571 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.04 
 
 		 533 aa  123  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.94 
 
 		 552 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 		 553 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 		 552 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.04 
 
 		 528 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  38.83 
 
 		 541 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 		 552 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  34.13 
 
 		 580 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>