More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0131 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 459 aa  935    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  59.86 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1565  60 kDa inner membrane insertion protein  36.67 
 
 		 526 aa  259  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150005  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.14 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.63 
 
 		 542 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  40.2 
 
 		 547 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  36.23 
 
 		 539 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  38.42 
 
 		 557 aa  153  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 		 554 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 		 554 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.09 
 
 		 575 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.93 
 
 		 581 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 		 542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.63 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  35.22 
 
 		 536 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  37.62 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.13 
 
 		 555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  40.1 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  41.76 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.27 
 
 		 550 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 560 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 552 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 552 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 560 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 560 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 560 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  36.76 
 
 		 562 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 560 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  39.3 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 553 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.87 
 
 		 577 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  39.13 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  39.34 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  35.96 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.65 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.29 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  40.94 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.84 
 
 		 557 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  35.19 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  34.96 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.47 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.86 
 
 		 578 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.83 
 
 		 578 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.62 
 
 		 532 aa  142  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 563 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.45 
 
 		 537 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  37.62 
 
 		 534 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4043  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.59 
 
 		 571 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  35.08 
 
 		 536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  36.18 
 
 		 565 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 548 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  39.01 
 
 		 223 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.19 
 
 		 607 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  36.1 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.31 
 
 		 541 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  36.99 
 
 		 556 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  36.18 
 
 		 567 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  36.99 
 
 		 556 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  38.07 
 
 		 545 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  40.59 
 
 		 536 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.69 
 
 		 584 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  35.35 
 
 		 300 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 543 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.82 
 
 		 548 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.81 
 
 		 567 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.17 
 
 		 672 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.31 
 
 		 543 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  35.68 
 
 		 571 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  34.67 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  33.7 
 
 		 609 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.84 
 
 		 550 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  36.82 
 
 		 557 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.32 
 
 		 544 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  30.14 
 
 		 614 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.97 
 
 		 531 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>