More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2947 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 
344 aa  707    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  38.13 
 
 
255 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  38.22 
 
 
258 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  37.97 
 
 
255 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  39.24 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  39.24 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  39.24 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  39.24 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  39.24 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  38.25 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  36.86 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  38.82 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  37.74 
 
 
256 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  38.22 
 
 
252 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.49 
 
 
249 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  40.43 
 
 
254 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  39.09 
 
 
260 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  39.09 
 
 
260 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  31.71 
 
 
300 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  33.07 
 
 
269 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  36.36 
 
 
260 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  38 
 
 
278 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  38.64 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  38.64 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  38.64 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  34.63 
 
 
286 aa  132  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  38.18 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.74 
 
 
223 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
539 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  37.73 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  37.73 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  36.62 
 
 
263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  34.78 
 
 
514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  38.65 
 
 
257 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  37.27 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.57 
 
 
542 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.15 
 
 
553 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.15 
 
 
554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.15 
 
 
554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.14 
 
 
544 aa  127  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
341 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  37.23 
 
 
556 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  38.71 
 
 
225 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  34.47 
 
 
217 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 
543 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.87 
 
 
541 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.57 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  36.41 
 
 
531 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  34.95 
 
 
536 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
544 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  33.94 
 
 
278 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  31.12 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.97 
 
 
575 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.16 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.04 
 
 
548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  34.97 
 
 
543 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
548 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
548 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 
540 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.38 
 
 
238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  36.61 
 
 
540 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  30.64 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  37.3 
 
 
515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  34.34 
 
 
583 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.78 
 
 
555 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  37.44 
 
 
584 aa  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 
541 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.33 
 
 
454 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 
543 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.38 
 
 
238 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.2 
 
 
541 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 
566 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  29.55 
 
 
337 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  36.02 
 
 
459 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  35.16 
 
 
536 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.22 
 
 
555 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 
546 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 
546 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.61 
 
 
630 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.52 
 
 
546 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 
597 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  34.83 
 
 
628 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  33.85 
 
 
528 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  38.16 
 
 
566 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 
600 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  30.9 
 
 
614 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>