More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3376 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
314 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  69.58 
 
 
365 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  64.5 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  64.26 
 
 
384 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  60.13 
 
 
382 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  48.62 
 
 
324 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  52.26 
 
 
350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  48 
 
 
324 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  49.85 
 
 
337 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  49.37 
 
 
366 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.76 
 
 
363 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  42.77 
 
 
332 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  45.11 
 
 
275 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  41.4 
 
 
334 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  40.77 
 
 
266 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  39.12 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  36.05 
 
 
335 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  40.07 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.78 
 
 
337 aa  192  7e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  35.97 
 
 
308 aa  185  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.89 
 
 
314 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  36.25 
 
 
461 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.81 
 
 
385 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  36.06 
 
 
462 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  34.15 
 
 
370 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  35.47 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  33.22 
 
 
338 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  34.32 
 
 
318 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.85 
 
 
351 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.97 
 
 
411 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  32.08 
 
 
366 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  32.37 
 
 
358 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.87 
 
 
376 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  30.25 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 
374 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
367 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
367 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.61 
 
 
367 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.11 
 
 
366 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.63 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  30.79 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.07 
 
 
518 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.14 
 
 
532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  34.51 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.46 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.91 
 
 
249 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  32.66 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  32.61 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  32.61 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  32.61 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  34.09 
 
 
223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  32.17 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  32.61 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  32.61 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  33.76 
 
 
255 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  31.54 
 
 
255 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.63 
 
 
553 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.05 
 
 
531 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  31.94 
 
 
258 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.11 
 
 
544 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  31.86 
 
 
252 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.19 
 
 
309 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  31.12 
 
 
269 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.17 
 
 
536 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.02 
 
 
532 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  32.66 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  31.05 
 
 
330 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  27.92 
 
 
256 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  31.14 
 
 
345 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.81 
 
 
542 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.69 
 
 
584 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  31.44 
 
 
217 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.26 
 
 
287 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.72 
 
 
542 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  30.67 
 
 
548 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.66 
 
 
536 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  37.26 
 
 
231 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  25.25 
 
 
281 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 
541 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.15 
 
 
530 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 
600 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  26.28 
 
 
278 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.15 
 
 
530 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0504  preprotein translocase subunit  39.34 
 
 
198 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  34.51 
 
 
229 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
528 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  34.08 
 
 
531 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  29.72 
 
 
537 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 
541 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 
268 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  28.24 
 
 
628 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  29.09 
 
 
536 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  28.05 
 
 
556 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  29.62 
 
 
459 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  30.63 
 
 
219 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 
528 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.22 
 
 
526 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 
541 aa  99.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>