More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2158 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
315 aa  638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  43.57 
 
 
308 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  41.61 
 
 
318 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.26 
 
 
363 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  40.75 
 
 
316 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.36 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  42.75 
 
 
462 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.82 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  42.11 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.82 
 
 
385 aa  212  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  37.94 
 
 
461 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  39.1 
 
 
351 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  40.92 
 
 
365 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  36.71 
 
 
337 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  40.07 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  40.98 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  38.58 
 
 
324 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  37.46 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  38.49 
 
 
315 aa  189  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  38.14 
 
 
366 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  42.03 
 
 
382 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  36.11 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  35.4 
 
 
328 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  40.07 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  33.43 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  39.7 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  37.06 
 
 
358 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  38.2 
 
 
332 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  39 
 
 
266 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  31.5 
 
 
346 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 
376 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.6 
 
 
390 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.01 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  35.88 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.47 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.72 
 
 
374 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.37 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.06 
 
 
544 aa  128  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  30.59 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.54 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.35 
 
 
532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.69 
 
 
553 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.93 
 
 
518 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.38 
 
 
577 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  27.27 
 
 
217 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  32.02 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.13 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 
630 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  28.84 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.14 
 
 
517 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  31.44 
 
 
268 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  31.2 
 
 
542 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  31.29 
 
 
261 aa  109  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 
584 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 
341 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  30.65 
 
 
345 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.37 
 
 
628 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.74 
 
 
542 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.92 
 
 
532 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.14 
 
 
309 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.9 
 
 
595 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.33 
 
 
541 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  30.7 
 
 
556 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.98 
 
 
557 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.57 
 
 
581 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  31.17 
 
 
330 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  33.46 
 
 
231 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  51.69 
 
 
213 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.3 
 
 
575 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  26.77 
 
 
256 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 
246 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  30.26 
 
 
548 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.57 
 
 
600 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.74 
 
 
223 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.73 
 
 
526 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.58 
 
 
536 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  32.58 
 
 
225 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  26.39 
 
 
257 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.59 
 
 
530 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  30.5 
 
 
556 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.59 
 
 
530 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  29.65 
 
 
559 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  29.07 
 
 
600 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.59 
 
 
528 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  30.5 
 
 
556 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 
560 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 
560 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  28.45 
 
 
699 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 
560 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.67 
 
 
567 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 
560 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  28.52 
 
 
229 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  32.31 
 
 
549 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  26.98 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  27.6 
 
 
255 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  30.05 
 
 
530 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  26.79 
 
 
425 aa  99  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>