More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_38030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 		 365 aa  747    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  75.08 
 
 		 315 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  62.12 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  69.58 
 
 		 314 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  60.76 
 
 		 382 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  53.99 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  48.44 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  46.11 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  54.58 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  47.8 
 
 		 324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.19 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  44.88 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  46.01 
 
 		 275 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  45.36 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  42.86 
 
 		 266 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  39.52 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  36.02 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  40.88 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  33.77 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.25 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  38.8 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  33.51 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.98 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  38.32 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.37 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  33.23 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  40.22 
 
 		 461 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.47 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  35.77 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  36.64 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.96 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.72 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.95 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  29.6 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.93 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  29.78 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  30.27 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  34.54 
 
 		 233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.33 
 
 		 287 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.89 
 
 		 532 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  28.09 
 
 		 628 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 		 518 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  27.89 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.13 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  29.15 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.51 
 
 		 544 aa  109  8.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  33.6 
 
 		 531 aa  109  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.26 
 
 		 542 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.24 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.5 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.8 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  28.46 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.6 
 
 		 595 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.48 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.1 
 
 		 532 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  31.3 
 
 		 268 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  27.52 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  29.93 
 
 		 699 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  31.73 
 
 		 536 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.83 
 
 		 543 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.85 
 
 		 584 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  30.47 
 
 		 271 aa  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.92 
 
 		 536 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.6 
 
 		 548 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.23 
 
 		 542 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  28.96 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  28.96 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  28.96 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  28.96 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  28.96 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  28.39 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.43 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.09 
 
 		 560 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  28.11 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  28.57 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  34.74 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 		 530 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.89 
 
 		 530 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  28.51 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  34.76 
 
 		 530 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.48 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.77 
 
 		 537 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 		 600 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.86 
 
 		 557 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 		 543 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.92 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  27.48 
 
 		 255 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  27.6 
 
 		 255 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.84 
 
 		 541 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0504  preprotein translocase subunit  33.5 
 
 		 198 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.67 
 
 		 575 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.24 
 
 		 249 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  27.21 
 
 		 261 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>