More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4169 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
324 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  90.15 
 
 
324 aa  584  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  75.75 
 
 
275 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  52.99 
 
 
332 aa  345  8.999999999999999e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  61.07 
 
 
266 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  51.37 
 
 
337 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  49.7 
 
 
384 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  48 
 
 
314 aa  316  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  47.8 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  45.74 
 
 
315 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  48.93 
 
 
382 aa  288  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.65 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  45.2 
 
 
350 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  45.48 
 
 
366 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  36.53 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  37.13 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  35.95 
 
 
335 aa  202  6e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37 
 
 
314 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  35.69 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  34.88 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.97 
 
 
385 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  35.19 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  37.23 
 
 
461 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
462 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  37.31 
 
 
338 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.63 
 
 
337 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  32.58 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  35.11 
 
 
318 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  32 
 
 
316 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  31.95 
 
 
366 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.43 
 
 
376 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.1 
 
 
374 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.93 
 
 
367 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.67 
 
 
366 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.44 
 
 
367 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.44 
 
 
367 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.88 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.72 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  28.7 
 
 
346 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  31.89 
 
 
358 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.48 
 
 
309 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  31.18 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  31.53 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  31.7 
 
 
255 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  31.7 
 
 
255 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  31.53 
 
 
258 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  31.25 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  31.25 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  31.25 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  31.25 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  31.25 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  30.8 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  31.25 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  28.61 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.7 
 
 
249 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  28.24 
 
 
256 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  28.14 
 
 
278 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.89 
 
 
542 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.76 
 
 
541 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.97 
 
 
544 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  32 
 
 
553 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  27.44 
 
 
233 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  29.7 
 
 
628 aa  105  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.22 
 
 
287 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  30.97 
 
 
548 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  31.42 
 
 
271 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  30.13 
 
 
330 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  30.8 
 
 
252 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  30.51 
 
 
223 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 
541 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  29.31 
 
 
246 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  28.85 
 
 
699 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.25 
 
 
517 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.3 
 
 
544 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.87 
 
 
543 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.74 
 
 
566 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  26.33 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  29.13 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.87 
 
 
543 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.27 
 
 
532 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.6 
 
 
541 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.08 
 
 
531 aa  97.1  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  29.31 
 
 
268 aa  96.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  36.43 
 
 
442 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.7 
 
 
518 aa  96.3  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.43 
 
 
543 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  28.86 
 
 
219 aa  95.9  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.56 
 
 
539 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 
532 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.57 
 
 
595 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  31.44 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  30.17 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  26.32 
 
 
271 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.8 
 
 
545 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 
540 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.08 
 
 
672 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  26.67 
 
 
254 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  30.17 
 
 
540 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  31 
 
 
260 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.41 
 
 
536 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>