More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3047 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  75.75 
 
 		 324 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  75.75 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  68.28 
 
 		 266 aa  361  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  50.94 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  47.21 
 
 		 337 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  46.01 
 
 		 365 aa  242  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  45.11 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  43.75 
 
 		 384 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  43.8 
 
 		 350 aa  234  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.12 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  41.04 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  43.17 
 
 		 382 aa  208  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  41.98 
 
 		 366 aa  198  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  35.87 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  36.76 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  40.08 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.91 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  33.59 
 
 		 335 aa  158  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.5 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  35.55 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  34.98 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  34.7 
 
 		 370 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.55 
 
 		 351 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  33.58 
 
 		 462 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  34.44 
 
 		 461 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  31.34 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  31.32 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  33.83 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.8 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.52 
 
 		 376 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.73 
 
 		 374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.92 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  34.47 
 
 		 358 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.96 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.96 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.96 
 
 		 367 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.32 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.12 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  34.05 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  29.81 
 
 		 233 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.21 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  30.34 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.27 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.7 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  30.04 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  27.78 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  29.2 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  28.75 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  29.36 
 
 		 583 aa  99  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  27.16 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  28.76 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 		 541 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  28.02 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.02 
 
 		 531 aa  97.8  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  27.51 
 
 		 553 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  30.17 
 
 		 223 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  28.95 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  26.52 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.3 
 
 		 541 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  27.04 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  31.25 
 
 		 548 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.89 
 
 		 564 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 		 517 aa  93.2  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.49 
 
 		 540 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  30.49 
 
 		 540 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.27 
 
 		 543 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.99 
 
 		 532 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  28.63 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.76 
 
 		 518 aa  90.5  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  26.67 
 
 		 628 aa  89.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.49 
 
 		 565 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 		 566 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.04 
 
 		 595 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  26.61 
 
 		 217 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.33 
 
 		 541 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.56 
 
 		 544 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 		 542 aa  89.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.65 
 
 		 542 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  31.08 
 
 		 271 aa  89  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.91 
 
 		 543 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.36 
 
 		 543 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  26.91 
 
 		 219 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  29.39 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.41 
 
 		 532 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  29.39 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.65 
 
 		 536 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  29.39 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  33.86 
 
 		 442 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  27.13 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.57 
 
 		 528 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  29.07 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.9 
 
 		 555 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  27.23 
 
 		 557 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>