More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6484 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
366 aa  750    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  52.88 
 
 
370 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  55.1 
 
 
338 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.72 
 
 
385 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  39.86 
 
 
462 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  37.96 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.06 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  33.51 
 
 
365 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 
363 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  39.45 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  32.44 
 
 
337 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  36.57 
 
 
308 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  37.45 
 
 
318 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  35.61 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.62 
 
 
374 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  30.11 
 
 
385 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.34 
 
 
314 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  34.46 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  31 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.28 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.47 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  35.04 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  31.89 
 
 
358 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.06 
 
 
376 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.05 
 
 
367 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  32.08 
 
 
314 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  35.13 
 
 
324 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  33.56 
 
 
382 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.07 
 
 
390 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  32.27 
 
 
351 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  35.6 
 
 
350 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  29.18 
 
 
366 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.35 
 
 
367 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.35 
 
 
367 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  31.55 
 
 
335 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  34.3 
 
 
324 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  33.83 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  32.71 
 
 
266 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  32.93 
 
 
332 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  30.43 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.34 
 
 
337 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
553 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  33.75 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.47 
 
 
553 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.89 
 
 
554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.89 
 
 
554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  35.02 
 
 
547 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.76 
 
 
584 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.82 
 
 
517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
552 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
552 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.86 
 
 
518 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 
555 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.5 
 
 
555 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.22 
 
 
552 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.22 
 
 
552 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31 
 
 
575 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 
555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  30.9 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.32 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  31.88 
 
 
557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  32.64 
 
 
556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  32.64 
 
 
556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  32.17 
 
 
536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.49 
 
 
557 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.2 
 
 
577 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  28.14 
 
 
278 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  30.12 
 
 
556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  32.17 
 
 
539 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.38 
 
 
581 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.48 
 
 
532 aa  109  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.36 
 
 
600 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.96 
 
 
578 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.85 
 
 
552 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  33.18 
 
 
531 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.96 
 
 
578 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  33.19 
 
 
545 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  30.24 
 
 
268 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  34.55 
 
 
542 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.89 
 
 
528 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.89 
 
 
530 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  32.73 
 
 
537 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  31.33 
 
 
557 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.73 
 
 
536 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>