More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3727 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 		 384 aa  778    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  61.13 
 
 		 365 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  67.49 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  64.26 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  59.62 
 
 		 315 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  58.38 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  48.63 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.09 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  49.54 
 
 		 324 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  49.84 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  46.01 
 
 		 350 aa  292  9e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  45.95 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  43.75 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 		 266 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  42.9 
 
 		 315 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  37.65 
 
 		 328 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.94 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.91 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  39.18 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  35.52 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  37.08 
 
 		 461 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  36.25 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  34.77 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  37.35 
 
 		 316 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  35.61 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  38.27 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  35.77 
 
 		 351 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  37.59 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.53 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  35.1 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.23 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.06 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.9 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.72 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  29 
 
 		 367 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.73 
 
 		 532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.35 
 
 		 366 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  30.16 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  29.39 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  32.21 
 
 		 628 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.5 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.5 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.76 
 
 		 542 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.03 
 
 		 531 aa  123  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  28.74 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.1 
 
 		 532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.71 
 
 		 518 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.34 
 
 		 517 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  33.19 
 
 		 268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.66 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 544 aa  116  7.999999999999999e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.8 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  28.31 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  30.89 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  33.47 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.53 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  29.09 
 
 		 255 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  28.36 
 
 		 255 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  28 
 
 		 255 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  28 
 
 		 255 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  28 
 
 		 255 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  28 
 
 		 255 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  28 
 
 		 255 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  31.9 
 
 		 330 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.32 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  31.56 
 
 		 256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  27.64 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 560 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  27.27 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.77 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.62 
 
 		 223 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 560 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  26.91 
 
 		 258 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.85 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 		 526 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.73 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  30.16 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.03 
 
 		 595 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 		 608 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.29 
 
 		 628 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  35 
 
 		 528 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  30.81 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  26.9 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.17 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  31.75 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.71 
 
 		 632 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 		 578 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  32.48 
 
 		 699 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  31.38 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  31.1 
 
 		 548 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  30.73 
 
 		 528 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.21 
 
 		 541 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 		 584 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  28.84 
 
 		 562 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>