More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4861 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  100 
 
 
411 aa  847    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  62.22 
 
 
390 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.71 
 
 
374 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
376 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.09 
 
 
367 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.66 
 
 
366 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.47 
 
 
367 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.47 
 
 
367 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  45.26 
 
 
358 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  50.18 
 
 
287 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  45.51 
 
 
346 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  43.21 
 
 
385 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.57 
 
 
385 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  32.12 
 
 
370 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  31.49 
 
 
338 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  33.44 
 
 
461 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  33.55 
 
 
462 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  30.47 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.15 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  32.72 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  33.97 
 
 
314 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  32.97 
 
 
351 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  33.11 
 
 
315 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  32.15 
 
 
366 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  33.45 
 
 
308 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  32.31 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.9 
 
 
384 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  32.26 
 
 
318 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  33.47 
 
 
315 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.95 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  31.16 
 
 
334 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  32.57 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  28.39 
 
 
350 aa  136  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  32.67 
 
 
324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  31.13 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  34.8 
 
 
382 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  29.89 
 
 
266 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  30.5 
 
 
328 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  28.91 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  31.09 
 
 
332 aa  116  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  26.39 
 
 
335 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  41.74 
 
 
257 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  27.37 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.63 
 
 
566 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  27.34 
 
 
257 aa  96.7  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  26.67 
 
 
281 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  27.27 
 
 
551 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  41.41 
 
 
278 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  38.26 
 
 
261 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.17 
 
 
541 aa  93.2  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  25.31 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.87 
 
 
309 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  26.18 
 
 
268 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  26.72 
 
 
557 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.91 
 
 
541 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  28.74 
 
 
553 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  26.29 
 
 
570 aa  87.8  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  26.62 
 
 
570 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.47 
 
 
623 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.84 
 
 
628 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  26.55 
 
 
254 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  26.62 
 
 
569 aa  86.7  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.47 
 
 
623 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  23.43 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  26.32 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.52 
 
 
575 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  27.71 
 
 
542 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.9 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  26.86 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.91 
 
 
626 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  26.94 
 
 
571 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  24.46 
 
 
542 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  23.77 
 
 
330 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  24.29 
 
 
541 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  24.37 
 
 
628 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  22.59 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.58 
 
 
581 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  36.56 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  24.37 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  25.26 
 
 
604 aa  83.6  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.91 
 
 
608 aa  83.2  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  24.5 
 
 
544 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  36.46 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  24.01 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  24.9 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  26.12 
 
 
567 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  26.45 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  23.69 
 
 
545 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  24.9 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  24.1 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  24.7 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  26.12 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.9 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.2 
 
 
564 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  24.46 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  24.46 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.38 
 
 
344 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  23.21 
 
 
548 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  25.62 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  23.74 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>