More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2035 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
336 aa  677    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  34.17 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  28.57 
 
 
556 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  33.47 
 
 
330 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  32.5 
 
 
545 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  31.17 
 
 
539 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.79 
 
 
566 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.67 
 
 
544 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  31.03 
 
 
542 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  28.46 
 
 
261 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  33.19 
 
 
544 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 
597 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  32 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.6 
 
 
542 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  28.42 
 
 
268 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  29.23 
 
 
225 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  31.47 
 
 
541 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  31.12 
 
 
541 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  29.41 
 
 
536 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  30.4 
 
 
246 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  28.81 
 
 
541 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.24 
 
 
575 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.8 
 
 
550 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.92 
 
 
541 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  28.81 
 
 
541 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.34 
 
 
567 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.81 
 
 
541 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.81 
 
 
541 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.81 
 
 
541 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.81 
 
 
541 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  31.91 
 
 
313 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.68 
 
 
544 aa  103  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0764  60 kDa inner membrane insertion protein  29.1 
 
 
311 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 
557 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  28.81 
 
 
541 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  31.51 
 
 
579 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.39 
 
 
541 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.93 
 
 
583 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.25 
 
 
536 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 
597 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  27.24 
 
 
542 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.16 
 
 
578 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.16 
 
 
578 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29 
 
 
553 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  29.83 
 
 
537 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  31.8 
 
 
583 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  30.24 
 
 
534 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  31.25 
 
 
699 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  25.1 
 
 
213 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 
597 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  28.39 
 
 
541 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  25.74 
 
 
257 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.55 
 
 
363 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  31.17 
 
 
271 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.57 
 
 
581 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.44 
 
 
560 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  29.22 
 
 
551 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.08 
 
 
541 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.11 
 
 
533 aa  99  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  29.86 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  24.25 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  31.51 
 
 
585 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  32.2 
 
 
584 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.31 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  45.19 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
541 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.85 
 
 
543 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.11 
 
 
565 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 
607 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  28.46 
 
 
223 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  31.22 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  29.1 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  30.67 
 
 
584 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.79 
 
 
565 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  25.95 
 
 
548 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.87 
 
 
600 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.94 
 
 
564 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  25.95 
 
 
548 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  28.16 
 
 
562 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.46 
 
 
620 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.35 
 
 
560 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.35 
 
 
560 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.91 
 
 
610 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.95 
 
 
548 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.52 
 
 
545 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.35 
 
 
560 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.91 
 
 
610 aa  96.3  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.46 
 
 
544 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.35 
 
 
560 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  27.07 
 
 
257 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  26.16 
 
 
370 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  29.11 
 
 
562 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.16 
 
 
563 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  28.86 
 
 
528 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>