More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5265 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 396 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.8 
 
 		 380 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  62.47 
 
 		 383 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.71 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.12 
 
 		 382 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.46 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.46 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.46 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.5 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.87 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.77 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.61 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.85 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.48 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.85 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.97 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.59 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.46 
 
 		 379 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  45.16 
 
 		 225 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 		 584 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  39.52 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  45.16 
 
 		 587 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  42.02 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 		 583 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  41.94 
 
 		 583 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 		 610 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 		 610 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  40.62 
 
 		 614 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  42.74 
 
 		 585 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  44.92 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  45.19 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.84 
 
 		 609 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.2 
 
 		 566 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 		 526 aa  96.3  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.1 
 
 		 518 aa  96.3  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.28 
 
 		 607 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.24 
 
 		 517 aa  95.9  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  39.84 
 
 		 616 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  39.84 
 
 		 616 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  39.06 
 
 		 605 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.66 
 
 		 544 aa  94.7  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.9 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 597 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  39.84 
 
 		 617 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  42.74 
 
 		 579 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 		 536 aa  92.8  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  41.12 
 
 		 607 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.95 
 
 		 530 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  42.61 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.74 
 
 		 532 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 632 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  38.28 
 
 		 624 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.95 
 
 		 528 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  36.67 
 
 		 553 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 620 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.17 
 
 		 584 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  45.13 
 
 		 592 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.66 
 
 		 531 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.86 
 
 		 787 aa  90.9  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.28 
 
 		 544 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  50 
 
 		 223 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  35.83 
 
 		 543 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 578 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  41.67 
 
 		 257 aa  90.9  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  39.84 
 
 		 609 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.96 
 
 		 541 aa  90.9  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  39.84 
 
 		 562 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 578 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  41.67 
 
 		 257 aa  90.5  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 		 600 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  38.6 
 
 		 628 aa  90.5  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.95 
 
 		 539 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  36.72 
 
 		 548 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 		 595 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  41.96 
 
 		 536 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 		 597 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  37.01 
 
 		 557 aa  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  42.59 
 
 		 699 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  35.94 
 
 		 556 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  35.94 
 
 		 556 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 		 597 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 		 581 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.72 
 
 		 621 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.83 
 
 		 533 aa  89.4  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.46 
 
 		 567 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.14 
 
 		 565 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  42.61 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  46.39 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.14 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.72 
 
 		 629 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 		 543 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.9 
 
 		 532 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 		 616 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  35.94 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  42.59 
 
 		 213 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  35.86 
 
 		 544 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.22 
 
 		 554 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 		 557 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.17 
 
 		 543 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  35.86 
 
 		 545 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>