More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2505 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2505  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 402 aa  837    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0602  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.48 
 
 		 588 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2875  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  27.75 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  26.87 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  27.5 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  26.18 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0757  putative microcin immunity protein  26.02 
 
 		 586 aa  126  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  27.57 
 
 		 421 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  26.58 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  26.58 
 
 		 457 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  27.37 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  28.13 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  26.24 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  28.12 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  25.58 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  26.78 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  25.34 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  26.74 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  25.36 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  25.14 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  26.6 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  27.46 
 
 		 451 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  25.9 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  25.13 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  27.71 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  24.62 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  26.91 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  26.05 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  26.18 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  27.14 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  27.7 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  24.45 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  26.03 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.85 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0409  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.87 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.574525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  24.47 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  24.45 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  26.07 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  25.75 
 
 		 410 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  25.76 
 
 		 421 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  24.73 
 
 		 421 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  24.49 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  25.56 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  25.06 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  25.82 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  24.07 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  26.02 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  25.77 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  26.74 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  25.69 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  25.53 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  24.92 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2696  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  26.11 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898944  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  26.04 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  26.29 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  26.29 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  23.68 
 
 		 428 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  26.14 
 
 		 423 aa  99.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  25.83 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  25.23 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19350  diaminopimelate decarboxylase  24.81 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.28871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  25.59 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  25.56 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  25.56 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  24.35 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  25.23 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  25.07 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  26.03 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  26.49 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  24.55 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  26.75 
 
 		 417 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0878  diaminopimelate decarboxylase  25.13 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.109774  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  25.83 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  25.25 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0576  diaminopimelate decarboxylase  25.58 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.757685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  27 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  26.11 
 
 		 412 aa  96.3  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  25.59 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  24.79 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  25.53 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  24.86 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1495  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.18 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  24.6 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  24.53 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  26.25 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  23.55 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  23.74 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.43 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  25.35 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  24.51 
 
 		 878 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  26.67 
 
 		 868 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  25.98 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  22.96 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  25.25 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  25.28 
 
 		 448 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>