More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2875 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2875  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  100 
 
 		 461 aa  948    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.13 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  31.88 
 
 		 447 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  31.24 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  29.23 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  30.09 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  30.37 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  29.67 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  30.8 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  29.84 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0409  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.39 
 
 		 409 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.574525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  31.41 
 
 		 430 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  28.37 
 
 		 439 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  29.65 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  30.82 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  29.84 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  29.63 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  27.69 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0609  diaminopimelate decarboxylase  29.77 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  28.24 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.11 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.552764  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  29.82 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  29.07 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4702  diaminopimelate decarboxylase  27.23 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  29.63 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14901  diaminopimelate decarboxylase  29.18 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.813083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0771  diaminopimelate decarboxylase  28.04 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.129495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0667  diaminopimelate decarboxylase  29.77 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00422384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.44 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.59 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  28.85 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0658  diaminopimelate decarboxylase  28.07 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  29.22 
 
 		 436 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1510  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1329  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1438  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1303  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  28.81 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1579  diaminopimelate decarboxylase  28.94 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1302  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 438 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  28.08 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  28.02 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  28.5 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  28.26 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1542  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  25.29 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  29.33 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1342  diaminopimelate decarboxylase  28.94 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.369143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  29.58 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0279  diaminopimelate decarboxylase  27.83 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  27.52 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1473  diaminopimelate decarboxylase  28 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  28.51 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1141  diaminopimelate decarboxylase  27.87 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11971  diaminopimelate decarboxylase  27.03 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0912  diaminopimelate decarboxylase  27.39 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  29 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0664  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.12 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  30.29 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  30.86 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  28.37 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  28.4 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3871  diaminopimelate decarboxylase  28 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.063243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  27.36 
 
 		 422 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 		 416 aa  143  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  29.69 
 
 		 424 aa  142  8e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0126  diaminopimelate decarboxylase  27.36 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  27.66 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0123  diaminopimelate decarboxylase  27.36 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.251884  normal  0.0757404 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  29.23 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0576  diaminopimelate decarboxylase  27.4 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.757685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  28.3 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  26.51 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  27.4 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  29.73 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  28.74 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  28.38 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0842  diaminopimelate decarboxylase  28.31 
 
 		 477 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0309438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0317  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.241285 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  28.67 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2505  diaminopimelate decarboxylase  27.75 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  26.27 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  26.84 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>