More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0409 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0409  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 409 aa  818    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.574525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2875  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  30.39 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  24.82 
 
 		 430 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  23.39 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  24.16 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0602  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.29 
 
 		 588 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  23.5 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  23.26 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  23.26 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  26.92 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  22.65 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2505  diaminopimelate decarboxylase  28.87 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  26.43 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  24.05 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0664  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  19.26 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  26.08 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  24.7 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  26.57 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  23.15 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  25.96 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.12 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  27.01 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  25.6 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  22.38 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  26.47 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.93 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  23.49 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.93 
 
 		 547 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.552764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  23.35 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  23.08 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  23.49 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  23.49 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  22.25 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  24.76 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 		 438 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.93 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  22.93 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  23.88 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  25.18 
 
 		 447 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  24.4 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  22.93 
 
 		 433 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  22.57 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  22.06 
 
 		 445 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  22.33 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  22.84 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  21.63 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.81 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  24.7 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0912  diaminopimelate decarboxylase  23.38 
 
 		 464 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  23.21 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  23.33 
 
 		 448 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  22.27 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14901  diaminopimelate decarboxylase  24.47 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.813083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  22.33 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  23.73 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  22.82 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  23.15 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  21 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0757  putative microcin immunity protein  27.51 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  24.88 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  20.63 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  21.8 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  24.26 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  24.77 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  21.8 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  21.84 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.84 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  23.62 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  22.75 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  23.11 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  22.09 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.47 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  22.25 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0658  diaminopimelate decarboxylase  23.93 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  20.63 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  24.09 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.13 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  21.41 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  21.63 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  21.8 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  22.03 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  24.65 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  19.9 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  21.55 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.86 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  22.57 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  26.98 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  22.49 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  21.6 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  21.6 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2435  diaminopimelate decarboxylase  22.79 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.588454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2696  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  24.3 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>