More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0602 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0602  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
588 aa  1217    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0757  putative microcin immunity protein  52.39 
 
 
586 aa  644    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2505  diaminopimelate decarboxylase  31.48 
 
 
402 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1728  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  42.6 
 
 
179 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.528186  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1747  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.88 
 
 
179 aa  150  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188764  hitchhiker  8.5342400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1652  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.31 
 
 
178 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1606  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.31 
 
 
178 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1731  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  42.01 
 
 
179 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2233  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.31 
 
 
178 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1789  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  42.01 
 
 
179 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00788192  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1550  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  42.01 
 
 
179 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1508  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.31 
 
 
178 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1725  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  42.01 
 
 
179 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01384  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.31 
 
 
179 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
179 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01395  hypothetical protein  39.31 
 
 
179 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1972  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  40.46 
 
 
186 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.710543  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0409  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.29 
 
 
409 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.574525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  31.25 
 
 
181 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2901  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
192 aa  101  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  25.26 
 
 
419 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  24.44 
 
 
425 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1515  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
181 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
180 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
182 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  31.4 
 
 
188 aa  97.4  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2875  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  24.36 
 
 
461 aa  97.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
180 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
182 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  26.2 
 
 
439 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
180 aa  96.3  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.64 
 
 
182 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  24.66 
 
 
420 aa  94.7  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4825  ribosomal-protein-serine acetyltransferase, putative  30.06 
 
 
182 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  32.94 
 
 
177 aa  94.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4820  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.06 
 
 
182 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
181 aa  94  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
181 aa  94  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  24.56 
 
 
438 aa  94  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4798  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.06 
 
 
182 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4435  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.48 
 
 
184 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  25.77 
 
 
457 aa  91.3  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4417  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.48 
 
 
184 aa  90.9  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4802  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.48 
 
 
184 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4582  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.48 
 
 
184 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4937  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.48 
 
 
184 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  25.5 
 
 
417 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  26.99 
 
 
187 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.5 
 
 
428 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  25.71 
 
 
427 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  24.22 
 
 
418 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  25.99 
 
 
427 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  24.09 
 
 
421 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
184 aa  87  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  25.71 
 
 
427 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  24.09 
 
 
421 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
182 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  24.15 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3234  diaminopimelate decarboxylase  24.54 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  23.38 
 
 
463 aa  86.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  22.99 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  26.99 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  26.49 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  25.6 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  24.69 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.42 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  24.6 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0664  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.43 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  23.29 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2696  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  25.36 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  24.42 
 
 
415 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  25.53 
 
 
417 aa  84  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  25.53 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  25.45 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  24.81 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  23.74 
 
 
417 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
422 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11961  diaminopimelate decarboxylase  22.06 
 
 
457 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  24.55 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  26.55 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  25.77 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
210 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  25.13 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1877  hypothetical protein  30.13 
 
 
183 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19350  diaminopimelate decarboxylase  25.37 
 
 
470 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.28871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.18 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  23.64 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6758  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.86 
 
 
425 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0394699  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  25.62 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  27.4 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21980  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000214127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  24.5 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  23.17 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  23.92 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  24.85 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  24.8 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  23.12 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  24.85 
 
 
417 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>