More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6758 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6758  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 425 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0394699  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2696  Orn/DAP/Arg decarboxylase family protein  44.66 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  30.29 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.75 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  31.79 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  32.2 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  33.43 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  31.99 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  32.12 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  31.36 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  28.01 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  29.18 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.53 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  32.98 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  27.25 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  30.34 
 
 		 434 aa  133  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.17 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  29.82 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  29.74 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  30.37 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  27.82 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  29.68 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  32.21 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  28.34 
 
 		 417 aa  130  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  26.32 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  31.01 
 
 		 421 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  31.76 
 
 		 421 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  31.59 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  32.54 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  27.75 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  29.2 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  28.13 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  30.16 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  29.11 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  27.23 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  30.87 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  28.87 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  29.01 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  30.21 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  29.56 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  30.34 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 421 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  30.45 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  29.58 
 
 		 423 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  27.73 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1365  diaminopimelate decarboxylase  26.57 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00386973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  29.24 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  33.6 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  34.02 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.94 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  26.13 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  30.73 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  27.57 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  30.73 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  28.02 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  33.81 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  22.76 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  30.97 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  28.5 
 
 		 421 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  29.91 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  28.83 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  28.72 
 
 		 434 aa  123  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  27.99 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  29.92 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  29.08 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  26.4 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  26.61 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.86 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  31.22 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  27.27 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  26.45 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  26.33 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  26.14 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  27.55 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  31.53 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  27.46 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  29.58 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  28.8 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  29.72 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  29.72 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  28.53 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  25.77 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  28.8 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  29.25 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>