274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1731 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1731  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  100 
 
 
179 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1789  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  99.44 
 
 
179 aa  376  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00788192  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1725  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  98.88 
 
 
179 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1550  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  98.88 
 
 
179 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1728  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  97.77 
 
 
179 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.528186  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1652  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  68.54 
 
 
178 aa  264  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1747  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  67.98 
 
 
179 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188764  hitchhiker  8.5342400000000005e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01384  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  67.98 
 
 
179 aa  262  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  67.98 
 
 
179 aa  262  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01395  hypothetical protein  67.98 
 
 
179 aa  262  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1606  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  67.98 
 
 
178 aa  262  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1508  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  67.98 
 
 
178 aa  261  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2233  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  67.98 
 
 
178 aa  261  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1972  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  63.79 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.710543  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0602  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.01 
 
 
588 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0757  putative microcin immunity protein  37.57 
 
 
586 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2901  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
186 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1515  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  31.87 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  24.71 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1877  hypothetical protein  27.65 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21980  hypothetical protein  27.65 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000214127 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  24.85 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4825  ribosomal-protein-serine acetyltransferase, putative  26.04 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4582  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.75 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4417  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.44 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4435  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.44 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4937  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.75 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4820  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.04 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4802  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.44 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  23.3 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32870  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.74 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.439449  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  24.55 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1985  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4798  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.15 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2506  acetyltransferase-like  26.71 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.219044  normal  0.689211 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  22.75 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0841  acetyltransferase  23.35 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.286189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.71 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 
210 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  30.61 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4804  acetyltransferase  26.74 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5168  acetyltransferase  26.74 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4217  GCN5-related N-acetyltransferase  19.75 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4665  acetyltransferase  27.75 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3743  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0951462  hitchhiker  0.000826014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6319  GCN5-related N-acetyltransferase  24.57 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0168  acetyltransferase, GNAT family  26.16 
 
 
187 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  31.63 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  31.63 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13110  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  24.04 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  27.18 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  31.63 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2080  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  30.63 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.484761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  30.61 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0844  acetyltransferase  34.48 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.125994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
295 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0299  N-acetyltransferase  34.18 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.219282  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1479  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.57 
 
 
178 aa  52  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.298398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
178 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1803  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  30.63 
 
 
194 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2275  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  30.63 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8709  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
225 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00819117  normal  0.126537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  30.61 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  27.27 
 
 
204 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
192 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05632  acetyltransferase  26.28 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000270  putative ribosomal-protein-serine N-acetyltransferase  22.16 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  27.35 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  30.61 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  23.67 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5077  acetyltransferase, GNAT family  27.17 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8645  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8007  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  27.18 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>