More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1652 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1652  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  100 
 
 		 178 aa  373  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01384  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  98.88 
 
 		 179 aa  369  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  98.88 
 
 		 179 aa  369  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1508  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  99.44 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01395  hypothetical protein  98.88 
 
 		 179 aa  369  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1606  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  99.44 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2233  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  99.44 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1747  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  99.44 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188764  hitchhiker  8.5342400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1728  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  68.54 
 
 		 179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.528186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1731  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  68.54 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1789  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  68.54 
 
 		 179 aa  263  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00788192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1725  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  68.54 
 
 		 179 aa  263  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1550  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  68.54 
 
 		 179 aa  263  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1972  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  62.15 
 
 		 186 aa  240  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.710543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0602  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.31 
 
 		 588 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0757  putative microcin immunity protein  36.99 
 
 		 586 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1515  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2901  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  34.38 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  28.16 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4825  ribosomal-protein-serine acetyltransferase, putative  28.24 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4820  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.47 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4582  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.06 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4937  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.06 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4798  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.47 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4417  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.06 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4435  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.06 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4802  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.06 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  24.71 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21980  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000214127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1877  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  25.64 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2506  acetyltransferase-like  27.33 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.219044  normal  0.689211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  24.36 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0841  acetyltransferase  28.47 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.286189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7367  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2564  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451663  normal  0.927347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1985  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32870  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.32 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.439449  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0168  acetyltransferase, GNAT family  27.89 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.73 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1479  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.28 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.298398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  36.08 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  36.08 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  36.08 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.08 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5077  acetyltransferase, GNAT family  32.69 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  36.08 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  36.08 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  36.08 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4665  acetyltransferase  27.59 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000270  putative ribosomal-protein-serine N-acetyltransferase  25.49 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  31.07 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  34.02 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4804  acetyltransferase  26.9 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5168  acetyltransferase  26.9 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0863  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  31.96 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.72 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  28.21 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  28.44 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1764  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>