177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2755 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1515  GCN5-related N-acetyltransferase  84.53 
 
 
181 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1725  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.65 
 
 
179 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1550  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.65 
 
 
179 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1789  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.65 
 
 
179 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00788192  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1728  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.65 
 
 
179 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.528186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1731  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.65 
 
 
179 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2233  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  38.27 
 
 
178 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1508  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  38.27 
 
 
178 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1652  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  38.27 
 
 
178 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01384  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  38.27 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01395  hypothetical protein  38.27 
 
 
179 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1606  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  39.6 
 
 
178 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1747  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.65 
 
 
179 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188764  hitchhiker  8.5342400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0602  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 
588 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1972  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  36.24 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.710543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0757  putative microcin immunity protein  33.74 
 
 
586 aa  94.4  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2901  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4820  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.23 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4825  ribosomal-protein-serine acetyltransferase, putative  30.23 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21980  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000214127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4582  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.65 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  29.88 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4937  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.65 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1877  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4798  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.07 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4417  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.65 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4802  putative ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.65 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.49 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4435  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.65 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  33.13 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  26.86 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0903  acetyltransferase  26.99 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.975526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  25.44 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1045  acetyltransferase  25.33 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000864347  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2506  acetyltransferase-like  26.8 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.219044  normal  0.689211 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0841  acetyltransferase  27.4 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.286189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354263  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
295 aa  58.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1764  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0838  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0220221  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5474  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.49 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4217  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0299  N-acetyltransferase  26.35 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.219282  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5702  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
233 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
206 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
187 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0808  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  28.95 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0364  hypothetical protein  29.3 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.204641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.95 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0168  acetyltransferase, GNAT family  27.7 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5077  acetyltransferase, GNAT family  24.84 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32870  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.17 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.439449  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0886  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1985  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4804  acetyltransferase  22.4 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
225 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5168  acetyltransferase  22.4 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  29.05 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4687  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535947  hitchhiker  0.00121502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2795  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  29.36 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.125941 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001020  putative ribosomal protein N-acetyltransferase  32.31 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4665  acetyltransferase  24.2 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1286  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0927  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
191 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1881  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2132  acetyltransferase, GNAT family  29.09 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.960299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  24.11 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.47 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0794  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988507  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  25.96 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  25.43 
 
 
202 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2049  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  28.44 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2442  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  28.44 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306017  normal  0.727054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2161  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  28.44 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>