More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0164 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  74.62 
 
 		 864 aa  1160    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3105  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.37 
 
 		 767 aa  724    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0164  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  100 
 
 		 1123 aa  2303    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  81.85 
 
 		 863 aa  1325    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3497  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.54 
 
 		 860 aa  1130    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1883  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 		 656 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 		 657 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2123  methyl-accepting chemotaxis protein  47.74 
 
 		 654 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 		 656 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.684691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.28 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 664 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.232427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 		 657 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2362  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.49 
 
 		 664 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02220  putative chemotaxis transducer  55.19 
 
 		 679 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0256  chemotaxis transducer  58.66 
 
 		 679 aa  499  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  53.55 
 
 		 945 aa  496  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0151  methyl-accepting chemotaxis protein  44.75 
 
 		 678 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 		 1029 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0728  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.66 
 
 		 792 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.066629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.53 
 
 		 793 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  47.49 
 
 		 775 aa  429  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  47.94 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3993  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.52 
 
 		 701 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.32 
 
 		 888 aa  386  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0158  chemotaxis protein  46.95 
 
 		 779 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0206  methyl-accepting chemotaxis protein  46.62 
 
 		 793 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2163  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.49 
 
 		 755 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.14 
 
 		 740 aa  350  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  51.63 
 
 		 705 aa  349  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  48.77 
 
 		 733 aa  347  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  53.12 
 
 		 752 aa  345  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.21 
 
 		 890 aa  343  8e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.49 
 
 		 745 aa  335  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2145  methyl-accepting chemotaxis protein  34.75 
 
 		 781 aa  334  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00046  chemotaxis protein  51.54 
 
 		 753 aa  327  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.35 
 
 		 843 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.85 
 
 		 845 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.522396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 		 706 aa  315  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.337027  normal  0.882129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2791  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 		 622 aa  312  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1531  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.49 
 
 		 1019 aa  305  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.301691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.35 
 
 		 853 aa  301  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00045  chemotaxis protein  55.48 
 
 		 691 aa  299  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.91 
 
 		 572 aa  293  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.98 
 
 		 587 aa  293  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.79 
 
 		 651 aa  293  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  55.45 
 
 		 559 aa  292  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  58.74 
 
 		 617 aa  291  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.59 
 
 		 589 aa  291  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 583 aa  290  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  55.59 
 
 		 586 aa  290  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 		 580 aa  290  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 		 707 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  60.31 
 
 		 609 aa  288  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.1 
 
 		 555 aa  288  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  59.92 
 
 		 608 aa  287  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.39 
 
 		 578 aa  287  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.23 
 
 		 584 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  60.23 
 
 		 584 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.86 
 
 		 579 aa  286  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.09 
 
 		 598 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 		 626 aa  286  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.47 
 
 		 566 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0276  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.87 
 
 		 657 aa  285  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461968  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 567 aa  285  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6319  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  55.94 
 
 		 601 aa  283  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  55.63 
 
 		 557 aa  283  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  45.91 
 
 		 740 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.63 
 
 		 557 aa  283  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  57.99 
 
 		 546 aa  283  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  55.63 
 
 		 557 aa  283  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  57.99 
 
 		 511 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0685  methyl-accepting chemotaxis protein  57.99 
 
 		 526 aa  282  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  58.16 
 
 		 546 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  56.94 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  58.16 
 
 		 546 aa  282  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0231  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.79 
 
 		 324 aa  282  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  58.16 
 
 		 546 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  58.16 
 
 		 546 aa  282  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.94 
 
 		 515 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  57.99 
 
 		 512 aa  281  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 		 537 aa  281  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2418  methyl-accepting chemotaxis protein  51.78 
 
 		 659 aa  281  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00134538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 		 586 aa  281  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  49.53 
 
 		 585 aa  281  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 		 575 aa  280  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.84 
 
 		 653 aa  280  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.47 
 
 		 597 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.81 
 
 		 513 aa  280  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 		 542 aa  280  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  61.81 
 
 		 513 aa  280  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.86 
 
 		 628 aa  280  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.84 
 
 		 653 aa  280  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 		 584 aa  280  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  54.84 
 
 		 600 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 		 635 aa  279  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.42 
 
 		 576 aa  280  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448898  normal  0.153923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.23 
 
 		 569 aa  279  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 		 527 aa  279  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>